SPNS1

SPNS1
Ідентифікатори
Символи	SPNS1, HSpin1, LAT, PP2030, SPIN1, SPINL, nrs, SPNS sphingolipid transporter 1 (putative), sphingolipid transporter 1 (putative), SLC62A1, SLC63A1
Зовнішні ІД	OMIM: 612583 MGI: 1920908 HomoloGene: 41530 GeneCards: SPNS1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • sphingolipid transporter activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мітохондріальна внутрішня мембрана • везикула • lysosomal membrane • мітохондрія • мембрана Біологічний процес • lipid transport • locomotion • трансмембранний транспорт • sphingosine-1-phosphate receptor signaling pathway • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	83985	73658
Ensembl	ENSG00000169682	ENSMUSG00000030741
UniProt	Q9H2V7	Q8R0G7
RefSeq (мРНК)	NM_001142448 NM_001142449 NM_001142450 NM_001142451 NM_032038	NM_023712
RefSeq (білок)	NP_001135920 NP_001135921 NP_001135922 NP_001135923 NP_114427	NP_076201
Локус (UCSC)	Хр. 16: 28.97 – 28.98 Mb	Хр. 7: 125.97 – 125.98 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SPNS1 (англ. Sphingolipid transporter 1 (putative)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 16-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 528 амінокислот, а молекулярна маса — 56 630.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGSDTAPFL		SQADDPDDGP		VPGTPGLPGS		TGNPKSEEPE		VPDQEGLQRI
TGLSPGRSAL		IVAVLCYINL		LNYMDRFTVA		GVLPDIEQFF		NIGDSSSGLI
QTVFISSYMV		LAPVFGYLGD		RYNRKYLMCG		GIAFWSLVTL		GSSFIPGEHF
WLLLLTRGLV		GVGEASYSTI		APTLIADLFV		ADQRSRMLSI		FYFAIPVGSG
LGYIAGSKVK		DMAGDWHWAL		RVTPGLGVVA		VLLLFLVVRE		PPRGAVERHS
DLPPLNPTSW		WADLRALARN		PSFVLSSLGF		TAVAFVTGSL		ALWAPAFLLR
SRVVLGETPP		CLPGDSCSSS		DSLIFGLITC		LTGVLGVGLG		VEISRRLRHS
NPRADPLVCA		TGLLGSAPFL		FLSLACARGS		IVATYIFIFI		GETLLSMNWA
IVADILLYVV		IPTRRSTAEA		FQIVLSHLLG		DAGSPYLIGL		ISDRLRRNWP
PSFLSEFRAL		QFSLMLCAFV		GALGGAAFLG		TAIFIEADRR		RAQLHVQGLL
HEAGSTDDRI		VVPQRGRSTR		VPVASVLI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт ліпідів, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, мітохондрії, внутрішній мембрані мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yanagisawa H., Miyashita T., Nakano Y., Yamamoto D. (2003). HSpin1, a transmembrane protein interacting with Bcl-2/Bcl-xL, induces a caspase-independent autophagic cell death. Cell Death Differ. 10: 798—807. PMID 12815463 DOI:10.1038/sj.cdd.4401246

Див. також

• Хромосома 16