SPOPL

SPOPL
Ідентифікатори
Символи	SPOPL, BTBD33, speckle type BTB/POZ protein like
Зовнішні ІД	MGI: 1924107 HomoloGene: 78016 GeneCards: SPOPL
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding Клітинна компонента • Cul3-RING ubiquitin ligase complex • цитоплазма • клітинне ядро • SCF ubiquitin ligase complex Біологічний процес • negative regulation of protein ubiquitination • Убіквітин-залежний протеоліз • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of proteolysis • ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	339745	76857
Ensembl	ENSG00000144228	ENSMUSG00000026771
UniProt	Q6IQ16	Q2M2N2
RefSeq (мРНК)	NM_001001664	NM_001165997 NM_001165998 NM_029773
RefSeq (білок)	NP_001001664	NP_001159469 NP_001159470 NP_084049
Локус (UCSC)	Хр. 2: 138.5 – 138.57 Mb	Хр. 2: 23.4 – 23.46 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SPOPL (англ. Speckle type BTB/POZ protein like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 392 амінокислот, а молекулярна маса — 44 647.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSREPTPPLP		GDMSTGPIAE		SWCYTQVKVV		KFSYMWTINN		FSFCREEMGE
VLKSSTFSSG		PSDKMKWCLR		VNPKGLDDES		KDYLSLYLLL		VSCPKSEVRA
KFKFSLLNAK		REETKAMESQ		RAYRFVQGKD		WGFKKFIRRD		FLLDEANGLL
PDDKLTLFCE		VSVVQDSVNI		SGHTNTNTLK		VPECRLAEDL		GNLWENTRFT
DCSFFVRGQE		FKAHKSVLAA		RSPVFNAMFE		HEMEESKKNR		VEINDLDPEV
FKEMMRFIYT		GRAPNLDKMA		DNLLAAADKY		ALERLKVMCE		EALCSNLSVE
NVADTLVLAD		LHSAEQLKAQ		AIDFINRCSV		LRQLGCKDGK		NWNSNQATDI
METSGWKSMI		QSHPHLVAEA		FRALASAQCP		QFGIPRKRLK		QS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як убіквітинування білків. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kent D., Bush E.W., Hooper J.E. (2006). Roadkill attenuates Hedgehog responses through degradation of Cubitus interruptus. Development. 133: 2001—2010. PMID 16651542 DOI:10.1242/dev.02370

Див. також

• Хромосома 2