SPPL2B

SPPL2B
Ідентифікатори
Символи	SPPL2B, IMP-4, IMP4, PSH4, PSL1, signal peptide peptidase like 2B
Зовнішні ІД	OMIM: 608239 MGI: 1920468 HomoloGene: 10605 GeneCards: SPPL2B
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • aspartic-type endopeptidase activity • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • aspartic endopeptidase activity, intramembrane cleaving Клітинна компонента • integral component of membrane • ендосома • центросома • комплекс Ґольджі • мембрана • integral component of cytoplasmic side of endoplasmic reticulum membrane • Golgi membrane • нуклеоплазма • lysosomal membrane • actin cytoskeleton • Golgi-associated vesicle membrane • лізосома • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane • endosome membrane • клітинна мембрана Біологічний процес • membrane protein proteolysis • протеоліз • membrane protein ectodomain proteolysis • membrane protein intracellular domain proteolysis • regulation of immune response • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56928	73218
Ensembl	ENSG00000005206	ENSMUSG00000035206
UniProt	Q8TCT7	Q3TD49
RefSeq (мРНК)	NM_001077238 NM_152988	NM_175195 NM_001358803 NM_001358804
RefSeq (білок)	NP_001070706 NP_694533	NP_780404 NP_001345732 NP_001345733
Локус (UCSC)	Хр. 19: 2.33 – 2.36 Mb	Хр. 10: 80.69 – 80.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SPPL2B (англ. Signal peptide peptidase like 2B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 592 амінокислот, а молекулярна маса — 64 644.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAVAAALA		RLLAAFLLLA		AQVACEYGMV		HVVSQAGGPE		GKDYCILYNP
QWAHLPHDLS		KASFLQLRNW		TASLLCSAAD		LPARGFSNQI		PLVARGNCTF
YEKVRLAQGS		GARGLLIVSR		ERLVPPGGNK		TQYDEIGIPV		ALLSYKDMLD
IFTRFGRTVR		AALYAPKEPV		LDYNMVIIFI		MAVGTVAIGG		YWAGSRDVKK
RYMKHKRDDG		PEKQEDEAVD		VTPVMTCVFV		VMCCSMLVLL		YYFYDLLVYV
VIGIFCLASA		TGLYSCLAPC		VRRLPFGKCR		IPNNSLPYFH		KRPQARMLLL
ALFCVAVSVV		WGVFRNEDQW		AWVLQDALGI		AFCLYMLKTI		RLPTFKACTL
LLLVLFLYDI		FFVFITPFLT		KSGSSIMVEV		ATGPSDSATR		EKLPMVLKVP
RLNSSPLALC		DRPFSLLGFG		DILVPGLLVA		YCHRFDIQVQ		SSRVYFVACT
IAYGVGLLVT		FVALALMQRG		QPALLYLVPC		TLVTSCAVAL		WRRELGVFWT
GSGFAKVLPP		SPWAPAPADG		PQPPKDSATP		LSPQPPSEEP		ATSPWPAEQS
PKSRTSEEMG		AGAPMREPGS		PAESEGRDQA		QPSPVTQPGA		SA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

• Grigorenko A.P., Moliaka Y.K., Korovaitseva G.I., Rogaev E.I. (2002). Novel class of polytopic proteins with domains associated with putative protease activity. Biochemistry (Mosc.). 67: 826—834. PMID 12139484 DOI:10.1023/A:1016365227942
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nyborg A.C., Ladd T.B., Jansen K., Kukar T., Golde T.E. (2006). Intramembrane proteolytic cleavage by human signal peptide peptidase like 3 and malaria signal peptide peptidase. FASEB J. 20: 1671—1679. PMID 16873890 DOI:10.1096/fj.06-5762com
• Martin L., Fluhrer R., Haass C. (2009). Substrate requirements for SPPL2b-dependent regulated intramembrane proteolysis. J. Biol. Chem. 284: 5662—5670. PMID 19114711 DOI:10.1074/jbc.M807485200

Див. також

• Хромосома 19