SRGAP1

SRGAP1
Ідентифікатори
Символи	SRGAP1, ARHGAP13, NMTC2, SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606523 MGI: 2152936 HomoloGene: 56898 GeneCards: SRGAP1
Пов'язані генетичні захворювання
фолікулярний рак щитоподібної залози
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • гіалоплазма • цитоплазма Біологічний процес • negative regulation of cell migration • GO:0072468 сигнальна трансдукція • regulation of small GTPase mediated signal transduction • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57522	117600
Ensembl	ENSG00000196935	ENSMUSG00000020121
UniProt	Q7Z6B7	Q91Z69
RefSeq (мРНК)	NM_020762 NM_001346201	NM_001081037 NM_001242411
RefSeq (білок)	NP_001333130 NP_065813	NP_001074506 NP_001229340
Локус (UCSC)	Хр. 12: 63.84 – 64.16 Mb	Хр. 10: 121.62 – 121.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SRGAP1 (англ. SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 085 амінокислот, а молекулярна маса — 124 264.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSTPSRFKKD		KEIIAEYESQ		VKEIRAQLVE		QQKCLEQQTE		MRVQLLQDLQ
DFFRKKAEIE		TEYSRNLEKL		AERFMAKTRS		TKDHQQYKKD		QNLLSPVNCW
YLLLNQVRRE		SKDHATLSDI		YLNNVIMRFM		QISEDSTRMF		KKSKEIAFQL
HEDLMKVLNE		LYTVMKTYHM		YHAESISAES		KLKEAEKQEE		KQIGRSGDPV
FHIRLEERHQ		RRSSVKKIEK		MKEKRQAKYS		ENKLKSIKAR		NEYLLTLEAT
NASVFKYYIH		DLSDLIDCCD		LGYHASLNRA		LRTYLSAEYN		LETSRHEGLD
IIENAVDNLE		PRSDKQRFME		MYPAAFCPPM		KFEFQSHMGD		EVCQVSAQQP
VQAELMLRYQ		QLQSRLATLK		IENEEVKKTT		EATLQTIQDM		VTIEDYDVSE
CFQHSRSTES		VKSTVSETYL		SKPSIAKRRA		NQQETEQFYF		MKLREYLEGS
NLITKLQAKH		DLLQRTLGEG		HRAEYMTTRP		PNVPPKPQKH		RKSRPRSQYN
TKLFNGDLET		FVKDSGQVIP		LIVESCIRFI		NLYGLQHQGI		FRVSGSQVEV
NDIKNSFERG		ENPLADDQSN		HDINSVAGVL		KLYFRGLENP		LFPKERFNDL
ISCIRIDNLY		ERALHIRKLL		LTLPRSVLIV		MRYLFAFLNH		LSQYSDENMM
DPYNLAICFG		PTLMPVPEIQ		DQVSCQAHVN		EIIKTIIIHH		ETIFPDAKEL
DGPVYEKCMA		GDDYCDSPYS		EHGTLEEVDQ		DAGTEPHTSE		DECEPIEAIA
KFDYVGRSAR		ELSFKKGASL		LLYHRASEDW		WEGRHNGIDG		LVPHQYIVVQ
DMDDTFSDTL		SQKADSEASS		GPVTEDKSSS		KDMNSPTDRH		PDGYLARQRK
RGEPPPPVRR		PGRTSDGHCP		LHPPHALSNS		SVDLGSPSLA		SHPRGLLQNR
GLNNDSPERR		RRPGHGSLTN		ISRHDSLKKI		DSPPIRRSTS		SGQYTGFNDH
KPLDPETIAQ		DIEETMNTAL		NELRELERQS		TAKHAPDVVL		DTLEQVKNSP
TPATSTESLS		PLHNVALRSS		EPQIRRSTSS		SSDTMSTFKP		MVAPRMGVQL
KPPALRPKPA		VLPKTNPTIG		PAPPPQGPTD		KSCTM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• Voss M., Lettau M., Janssen O. (2009). Identification of SH3 domain interaction partners of human FasL (CD178) by phage display screening. BMC Immunol. 10: 53—53. PMID 19807924 DOI:10.1186/1471-2172-10-53
• Coutinho-Budd J., Ghukasyan V., Zylka M.J., Polleux F. (2012). The F-BAR domains from srGAP1, srGAP2, and srGAP3 differentially regulate membrane deformation. J. Cell Sci. 125: 3390—3401. PMID 22467852 DOI:10.1242/jcs.098962

Див. також

• Хромосома 12