SRGAP3

SRGAP3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1AM4, 1GRN, 1OW3, 1RGP, 1TX4, 2NGR
Ідентифікатори
Символи	SRGAP3, ARHGAP14, MEGAP, SRGAP2, WRP, SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 3
Зовнішні ІД	OMIM: 606525 MGI: 2152938 HomoloGene: 56686 GeneCards: SRGAP3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • negative regulation of cell migration • regulation of small GTPase mediated signal transduction • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9901	259302
Ensembl	ENSG00000196220	ENSMUSG00000030257
UniProt	O43295	Q812A2
RefSeq (мРНК)	NM_001033116 NM_001033117 NM_014850	NM_080448 NM_153070
RefSeq (білок)	NP_001028289 NP_055665	NP_536696
Локус (UCSC)	Хр. 3: 8.98 – 9.36 Mb	Хр. 6: 112.69 – 112.92 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SRGAP3 (англ. SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 099 амінокислот, а молекулярна маса — 124 504.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSQTKFKKD		KEIIAEYEAQ		IKEIRTQLVE		QFKCLEQQSE		SRLQLLQDLQ
EFFRRKAEIE		LEYSRSLEKL		AERFSSKIRS		SREHQFKKDQ		YLLSPVNCWY
LVLHQTRRES		RDHATLNDIF		MNNVIVRLSQ		ISEDVIRLFK		KSKEIGLQMH
EELLKVTNEL		YTVMKTYHMY		HAESISAESK		LKEAEKQEEK		QFNKSGDLSM
NLLRHEDRPQ		RRSSVKKIEK		MKEKRQAKYS		ENKLKCTKAR		NDYLLNLAAT
NAAISKYYIH		DVSDLIDCCD		LGFHASLART		FRTYLSAEYN		LETSRHEGLD
VIENAVDNLD		SRSDKHTVMD		MCNQVFCPPL		KFEFQPHMGD		EVCQVSAQQP
VQTELLMRYH		QLQSRLATLK		IENEEVRKTL		DATMQTLQDM		LTVEDFDVSD
AFQHSRSTES		VKSAASETYM		SKINIAKRRA		NQQETEMFYF		TKFKEYVNGS
NLITKLQAKH		DLLKQTLGEG		ERAECGTTRP		PCLPPKPQKM		RRPRPLSVYS
HKLFNGSMEA		FIKDSGQAIP		LVVESCIRYI		NLYGLQQQGI		FRVPGSQVEV
NDIKNSFERG		EDPLVDDQNE		RDINSVAGVL		KLYFRGLENP		LFPKERFQDL
ISTIKLENPA		ERVHQIQQIL		VTLPRVVIVV		MRYLFAFLNH		LSQYSDENMM
DPYNLAICFG		PTLMHIPDGQ		DPVSCQAHIN		EVIKTIIIHH		EAIFPSPREL
EGPVYEKCMA		GGEEYCDSPH		SEPGAIDEVD		HDNGTEPHTS		DEEVEQIEAI
AKFDYMGRSP		RELSFKKGAS		LLLYHRASED		WWEGRHNGVD		GLIPHQYIVV
QDMDDAFSDS		LSQKADSEAS		SGPLLDDKAS		SKNDLQSPTE		HISDYGFGGV
MGRVRLRSDG		AAIPRRRSGG		DTHSPPRGLG		PSIDTPPRAA		ACPSSPHKIP
LTRGRIESPE		KRRMATFGSA		GSINYPDKKA		LSEGHSMRST		CGSTRHSSLG
DHKSLEAEAL		AEDIEKTMST		ALHELRELER		QNTVKQAPDV		VLDTLEPLKN
PPGPVSSEPA		SPLHTIVIRD		PDAAMRRSSS		SSTEMMTTFK		PALSARLAGA
QLRPPPMRPV		RPVVQHRSSS		SSSSGVGSPA		VTPTEKMFPN		SSADKSGTM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг.

Література

• Voss M., Lettau M., Janssen O. (2009). Identification of SH3 domain interaction partners of human FasL (CD178) by phage display screening. BMC Immunol. 10: 53—53. PMID 19807924 DOI:10.1186/1471-2172-10-53

Див. також

• Хромосома 3