SSPN

SSPN
Ідентифікатори
Символи	SSPN, DAGA5, KRAG, NSPN, SPN1, SPN2, sarcospan
Зовнішні ІД	OMIM: 601599 MGI: 1353511 HomoloGene: 3727 GeneCards: SSPN
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8082	16651
Ensembl	ENSG00000123096	ENSMUSG00000030255
UniProt	Q14714	Q62147
RefSeq (мРНК)	NM_001135823 NM_005086	NM_010656 NM_001310837
RefSeq (білок)	NP_001129295 NP_005077	NP_001297766 NP_034786
Локус (UCSC)	Хр. 12: 26.12 – 26.3 Mb	Хр. 6: 145.88 – 145.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SSPN (англ. Sarcospan) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 243 амінокислот, а молекулярна маса — 26 618.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGKNKQPRGQ		QRQGGPPAAD		AAGPDDMEPK		KGTGAPKECG		EEEPRTCCGC
RFPLLLALLQ		LALGIAVTVV		GFLMASISSS		LLVRDTPFWA		GIIVCLVAYL
GLFMLCVSYQ		VDERTCIQFS		MKLLYFLLSA		LGLTVCVLAV		AFAAHHYSQL
TQFTCETTLD		SCQCKLPSSE		PLSRTFVYRD		VTDCTSVTGT		FKLFLLIQMI
LNLVCGLVCL		LACFVMWKHR		YQVFYVGVRI		CSLTASEGPQ		QKI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

• Crosbie R.H., Heighway J., Venzke D.P., Lee J.C., Campbell K.P. (1997). Sarcospan, the 25-kDa transmembrane component of the dystrophin-glycoprotein complex. J. Biol. Chem. 272: 31221—31224. PMID 9395445 DOI:10.1074/jbc.272.50.31221
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Heighway J., Betticher D.C., Hoban P.R., Altermatt H.J., Cowen R. (1996). Coamplification in tumors of KRAS2, type 2 inositol 1,4,5 triphosphate receptor gene, and a novel human gene, KRAG. Genomics. 35: 207—214. PMID 8661122 DOI:10.1006/geno.1996.0340

Див. також

• Хромосома 12