STARD3

STARD3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1EM2, 5I9J
Ідентифікатори
Символи	STARD3, CAB1, MLN64, es64, StAR related lipid transfer domain containing 3
Зовнішні ІД	OMIM: 607048 MGI: 1929618 HomoloGene: 38227 GeneCards: STARD3
Онтологія гена Молекулярна функція • lipid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cholesterol binding • GO:0017127 cholesterol transfer activity • protein homodimerization activity Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • lysosomal membrane • ендосома • мембрана • late endosome • гіалоплазма • мітохондрія • endoplasmic reticulum membrane • late endosome membrane • organelle membrane contact site • endoplasmic reticulum-endosome membrane contact site Біологічний процес • steroid metabolic process • progesterone biosynthetic process • lipid transport • cholesterol metabolic process • mitochondrial transport • lipid metabolism • C21-steroid hormone biosynthetic process • cholesterol transport • vesicle tethering to endoplasmic reticulum • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10948	59045
Ensembl	ENSG00000131748	ENSMUSG00000018167
UniProt	Q14849	Q61542
RefSeq (мРНК)	NM_001165937 NM_001165938 NM_006804	NM_021547
RefSeq (білок)	NP_001159409 NP_001159410 NP_006795	NP_067522
Локус (UCSC)	Хр. 17: 39.64 – 39.66 Mb	Хр. 11: 98.25 – 98.27 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

STARD3 (англ. StAR related lipid transfer domain containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 445 амінокислот, а молекулярна маса — 50 502.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSKLPRELTR		DLERSLPAVA		SLGSSLSHSQ		SLSSHLLPPP		EKRRAISDVR
RTFCLFVTFD		LLFISLLWII		ELNTNTGIRK		NLEQEIIQYN		FKTSFFDIFV
LAFFRFSGLL		LGYAVLRLRH		WWVIAVTTLV		SSAFLIVKVI		LSELLSKGAF
GYLLPIVSFV		LAWLETWFLD		FKVLPQEAEE		ERWYLAAQVA		VARGPLLFSG
ALSEGQFYSP		PESFAGSDNE		SDEEVAGKKS		FSAQEREYIR		QGKEATAVVD
QILAQEENWK		FEKNNEYGDT		VYTIEVPFHG		KTFILKTFLP		CPAELVYQEV
ILQPERMVLW		NKTVTACQIL		QRVEDNTLIS		YDVSAGAAGG		VVSPRDFVNV
RRIERRRDRY		LSSGIATSHS		AKPPTHKYVR		GENGPGGFIV		LKSASNPRVC
TFVWILNTDL		KGRLPRYLIH		QSLAATMFEF		AFHLRQRISE		LGARA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт ліпідів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у мембрані, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Alpy F., Tomasetto C. (2006). MLN64 and MENTHO, two mediators of endosomal cholesterol transport. Biochem. Soc. Trans. 34: 343—345. PMID 16709157 DOI:10.1042/BST0340343
• Murcia M., Faraldo-Gomez J.D., Maxfield F.R., Roux B. (2006). Modeling the structure of the StART domains of MLN64 and StAR proteins in complex with cholesterol. J. Lipid Res. 47: 2614—2630. PMID 16990645 DOI:10.1194/jlr.M600232-JLR200
• Charman M., Kennedy B.E., Osborne N., Karten B. (2010). MLN64 mediates egress of cholesterol from endosomes to mitochondria in the absence of functional Niemann-Pick Type C1 protein. J. Lipid Res. 51: 1023—1034. PMID 19965586 DOI:10.1194/jlr.M002345
• Li B., Vachali P., Frederick J.M., Bernstein P.S. (2011). Identification of StARD3 as a lutein-binding protein in the macula of the primate retina. Biochemistry. 50: 2541—2549. PMID 21322544 DOI:10.1021/bi101906y
• Liapis A., Chen F.W., Davies J.P., Wang R., Ioannou Y.A. (2012). MLN64 transport to the late endosome is regulated by binding to 14-3-3 via a non-canonical binding site. PLoS ONE. 7: E34424—E34424. PMID 22514632 DOI:10.1371/journal.pone.0034424

Див. також

• Хромосома 17