SURF4

SURF4
Ідентифікатори
Символи	SURF4, ERV29, surfeit 4
Зовнішні ІД	OMIM: 185660 MGI: 98445 HomoloGene: 6052 GeneCards: SURF4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane • ендоплазматичний ретикулум • мембрана • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment • transport vesicle • endoplasmic reticulum membrane • Golgi membrane • клітинна мембрана • azurophil granule membrane • гіалоплазма Біологічний процес • early endosome to Golgi transport • positive regulation of organelle organization • protein exit from endoplasmic reticulum • Golgi organization • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • neutrophil degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6836	20932
Ensembl	ENSG00000148248 ENSG00000280951	н/д
UniProt	O15260	Q64310
RefSeq (мРНК)	NM_001280788 NM_001280789 NM_001280790 NM_001280791 NM_001280792 NM_001280793 NM_033161	NM_011512
RefSeq (білок)	NP_001267717 NP_001267718 NP_001267719 NP_001267720 NP_001267721 NP_001267722 NP_149351	NP_035642
Локус (UCSC)	Хр. 9: 133.36 – 133.38 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SURF4 (англ. Surfeit 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 269 амінокислот, а молекулярна маса — 30 394.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGQNDLMGTA		EDFADQFLRV		TKQYLPHVAR		LCLISTFLED		GIRMWFQWSE
QRDYIDTTWN		CGYLLASSFV		FLNLLGQLTG		CVLVLSRNFV		QYACFGLFGI
IALQTIAYSI		LWDLKFLMRN		LALGGGLLLL		LAESRSEGKS		MFAGVPTMRE
SSPKQYMQLG		GRVLLVLMFM		TLLHFDASFF		SIVQNIVGTA		LMILVAIGFK
TKLAALTLVV		WLFAINVYFN		AFWTIPVYKP		MHDFLKYDFF		QTMSVIGGLL
LVVALGPGGV		SMDEKKKEW

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Reeves J.E., Fried M. (1995). The surf-4 gene encodes a novel 30 kDa integral membrane protein. Mol. Membr. Biol. 12: 201—208. PMID 7540914 DOI:10.3109/09687689509027508
• Duhig T., Ruhrberg C., Mor O., Fried M. (1998). The human Surfeit locus. Genomics. 52: 72—78. PMID 9740673 DOI:10.1006/geno.1998.5372
• Mitrovic S., Ben-Tekaya H., Koegler E., Gruenberg J., Hauri H.-P. (2008). The cargo receptors Surf4, endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment (ERGIC)-53, and p25 are required to maintain the architecture of ERGIC and Golgi. Mol. Biol. Cell. 19: 1976—1990. PMID 18287528 DOI:10.1091/mbc.E07-10-0989

Див. також

• Хромосома 9