SVEP1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
SVEP1
Ідентифікатори
Символи SVEP1, C9orf13, CCP22, POLYDOM, SEL-OB, SELOB, sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain containing 1
Зовнішні ІД OMIM: 611691 MGI: 1928849 HomoloGene: 23386 GeneCards: SVEP1
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_153366
NM_024500
NM_022814
RefSeq (білок)
NP_699197
NP_073725
Локус (UCSC) Хр. 9: 110.37 – 110.58 Mb Хр. 4: 58.04 – 58.21 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SVEP1 (англ. Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 9-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 571 амінокислот, а молекулярна маса — 390 170[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MWPRLAFCCWGLALVSGWATFQQMSPSRNFSFRLFPETAPGAPGSIPAPP
APGDEAAGSRVERLGQAFRRRVRLLRELSERLELVFLVDDSSSVGEVNFR
SELMFVRKLLSDFPVVPTATRVAIVTFSSKNYVVPRVDYISTRRARQHKC
ALLLQEIPAISYRGGGTYTKGAFQQAAQILLHARENSTKVVFLITDGYSN
GGDPRPIAASLRDSGVEIFTFGIWQGNIRELNDMASTPKEEHCYLLHSFE
EFEALARRALHEDLPSGSFIQDDMVHCSYLCDEGKDCCDRMGSCKCGTHT
GHFECICEKGYYGKGLQYECTACPSGTYKPEGSPGGISSCIPCPDENHTS
PPGSTSPEDCVCREGYRASGQTCELVHCPALKPPENGYFIQNTCNNHFNA
ACGVRCHPGFDLVGSSIILCLPNGLWSGSESYCRVRTCPHLRQPKHGHIS
CSTREMLYKTTCLVACDEGYRLEGSDKLTCQGNSQWDGPEPRCVERHCST
FQMPKDVIISPHNCGKQPAKFGTICYVSCRQGFILSGVKEMLRCTTSGKW
NVGVQAAVCKDVEAPQINCPKDIEAKTLEQQDSANVTWQIPTAKDNSGEK
VSVHVHPAFTPPYLFPIGDVAIVYTATDLSGNQASCIFHIKVIDAEPPVI
DWCRSPPPVQVSEKVHAASWDEPQFSDNSGAELVITRSHTQGDLFPQGET
IVQYTATDPSGNNRTCDIHIVIKGSPCEIPFTPVNGDFICTPDNTGVNCT
LTCLEGYDFTEGSTDKYYCAYEDGVWKPTYTTEWPDCAKKRFANHGFKSF
EMFYKAARCDDTDLMKKFSEAFETTLGKMVPSFCSDAEDIDCRLEENLTK
KYCLEYNYDYENGFAIGPGGWGAANRLDYSYDDFLDTVQETATSIGNAKS
SRIKRSAPLSDYKIKLIFNITASVPLPDERNDTLEWENQQRLLQTLETIT
NKLKRTLNKDPMYSFQLASEILIADSNSLETKKASPFCRPGSVLRGRMCV
NCPLGTYYNLEHFTCESCRIGSYQDEEGQLECKLCPSGMYTEYIHSRNIS
DCKAQCKQGTYSYSGLETCESCPLGTYQPKFGSRSCLSCPENTSTVKRGA
VNISACGVPCPEGKFSRSGLMPCHPCPRDYYQPNAGKAFCLACPFYGTTP
FAGSRSITECSSFSSTFSAAEESVVPPASLGHIKKRHEISSQVFHECFFN
PCHNSGTCQQLGRGYVCLCPLGYTGLKCETDIDECSPLPCLNNGVCKDLV
GEFICECPSGYTGQRCEENINECSSSPCLNKGICVDGVAGYRCTCVKGFV
GLHCETEVNECQSNPCLNNAVCEDQVGGFLCKCPPGFLGTRCGKNVDECL
SQPCKNGATCKDGANSFRCLCAAGFTGSHCELNINECQSNPCRNQATCVD
ELNSYSCKCQPGFSGKRCETEQSTGFNLDFEVSGIYGYVMLDGMLPSLHA
LTCTFWMKSSDDMNYGTPISYAVDNGSDNTLLLTDYNGWVLYVNGREKIT
NCPSVNDGRWHHIAITWTSANGIWKVYIDGKLSDGGAGLSVGLPIPGGGA
LVLGQEQDKKGEGFSPAESFVGSISQLNLWDYVLSPQQVKSLATSCPEEL
SKGNVLAWPDFLSGIVGKVKIDSKSIFCSDCPRLGGSVPHLRTASEDLKP
GSKVNLFCDPGFQLVGNPVQYCLNQGQWTQPLPHCERISCGVPPPLENGF
HSADDFYAGSTVTYQCNNGYYLLGDSRMFCTDNGSWNGVSPSCLDVDECA
VGSDCSEHASCLNVDGSYICSCVPPYTGDGKNCAEPIKCKAPGNPENGHS
SGEIYTVGAEVTFSCQEGYQLMGVTKITCLESGEWNHLIPYCKAVSCGKP
AIPENGCIEELAFTFGSKVTYRCNKGYTLAGDKESSCLANSSWSHSPPVC
EPVKCSSPENINNGKYILSGLTYLSTASYSCDTGYSLQGPSIIECTASGI
WDRAPPACHLVFCGEPPAIKDAVITGNNFTFRNTVTYTCKEGYTLAGLDT
IECLADGKWSRSDQQCLAVSCDEPPIVDHASPETAHRLFGDIAFYYCSDG
YSLADNSQLLCNAQGKWVPPEGQDMPRCIAHFCEKPPSVSYSILESVSKA
KFAAGSVVSFKCMEGFVLNTSAKIECMRGGQWNPSPMSIQCIPVRCGEPP
SIMNGYASGSNYSFGAMVAYSCNKGFYIKGEKKSTCEATGQWSSPIPTCH
PVSCGEPPKVENGFLEHTTGRIFESEVRYQCNPGYKSVGSPVFVCQANRH
WHSESPLMCVPLDCGKPPPIQNGFMKGENFEVGSKVQFFCNEGYELVGDS
SWTCQKSGKWNKKSNPKCMPAKCPEPPLLENQLVLKELTTEVGVVTFSCK
EGHVLQGPSVLKCLPSQQWNDSFPVCKIVLCTPPPLISFGVPIPSSALHF
GSTVKYSCVGGFFLRGNSTTLCQPDGTWSSPLPECVPVECPQPEEIPNGI
IDVQGLAYLSTALYTCKPGFELVGNTTTLCGENGHWLGGKPTCKAIECLK
PKEILNGKFSYTDLHYGQTVTYSCNRGFRLEGPSALTCLETGDWDVDAPS
CNAIHCDSPQPIENGFVEGADYSYGAIIIYSCFPGFQVAGHAMQTCEESG
WSSSIPTCMPIDCGLPPHIDFGDCTKLKDDQGYFEQEDDMMEVPYVTPHP
PYHLGAVAKTWENTKESPATHSSNFLYGTMVSYTCNPGYELLGNPVLICQ
EDGTWNGSAPSCISIECDLPTAPENGFLRFTETSMGSAVQYSCKPGHILA
GSDLRLCLENRKWSGASPRCEAISCKKPNPVMNGSIKGSNYTYLSTLYYE
CDPGYVLNGTERRTCQDDKNWDEDEPICIPVDCSSPPVSANGQVRGDEYT
FQKEIEYTCNEGFLLEGARSRVCLANGSWSGATPDCVPVRCATPPQLANG
VTEGLDYGFMKEVTFHCHEGYILHGAPKLTCQSDGNWDAEIPLCKPVNCG
PPEDLAHGFPNGFSFIHGGHIQYQCFPGYKLHGNSSRRCLSNGSWSGSSP
SCLPCRCSTPVIEYGTVNGTDFDCGKAARIQCFKGFKLLGLSEITCEADG
QWSSGFPHCEHTSCGSLPMIPNAFISETSSWKENVITYSCRSGYVIQGSS
DLICTEKGVWSQPYPVCEPLSCGSPPSVANAVATGEAHTYESEVKLRCLE
GYTMDTDTDTFTCQKDGRWFPERISCSPKKCPLPENITHILVHGDDFSVN
RQVSVSCAEGYTFEGVNISVCQLDGTWEPPFSDESCSPVSCGKPESPEHG
FVVGSKYTFESTIIYQCEPGYELEGNRERVCQENRQWSGGVAICKETRCE
TPLEFLNGKADIENRTTGPNVVYSCNRGYSLEGPSEAHCTENGTWSHPVP
LCKPNPCPVPFVIPENALLSEKEFYVDQNVSIKCREGFLLQGHGIITCNP
DETWTQTSAKCEKISCGPPAHVENAIARGVHYQYGDMITYSCYSGYMLEG
FLRSVCLENGTWTSPPICRAVCRFPCQNGGICQRPNACSCPEGWMGRLCE
EPICILPCLNGGRCVAPYQCDCPPGWTGSRCHTAVCQSPCLNGGKCVRPN
RCHCLSSWTGHNCSRKRRTGF

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, мембрані. Також секретований назовні.

Література

[ред. | ред. код]
  • Shur I., Socher R., Hameiri M., Fried A., Benayahu D. (2006). Molecular and cellular characterization of SEL-OB/SVEP1 in osteogenic cells in vivo and in vitro. J. Cell. Physiol. 206: 420—427. PMID 16206243 DOI:10.1002/jcp.20497
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Halim A., Nilsson J., Ruetschi U., Hesse C., Larson G. (2011). Human urinary glycoproteomics; attachment site specific analysis of N-and O-linked glycosylations by CID and ECD. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 22171320 DOI:10.1074/mcp.M111.013649

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15985 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.
  4. UniProt, Q4LDE5 (англ.) . Архів оригіналу за 25 лютого 2018. Процитовано 19 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]