SYNGR1

SYNGR1
Ідентифікатори
Символи	SYNGR1, synaptogyrin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603925 MGI: 1328323 HomoloGene: 3456 GeneCards: SYNGR1
Пов'язані генетичні захворювання
ревматоїдний артрит
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • Меланосома • integral component of membrane • міжклітинні контакти • neuromuscular junction • синапс • synaptic vesicle membrane • мембрана • Синаптичні бульбашки • клітинна мембрана • azurophil granule membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • integral component of synaptic vesicle membrane Біологічний процес • regulation of short-term neuronal synaptic plasticity • сортування білків • regulation of long-term neuronal synaptic plasticity • neutrophil degranulation • cellular response to leukemia inhibitory factor • regulated exocytosis • synaptic vesicle membrane organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9145	20972
Ensembl	ENSG00000100321	ENSMUSG00000022415
UniProt	O43759	O55100
RefSeq (мРНК)	NM_145738 NM_004711 NM_145731	NM_009303 NM_207708
RefSeq (білок)	NP_004702 NP_663783 NP_663791	NP_033329 NP_997591
Локус (UCSC)	Хр. 22: 39.35 – 39.39 Mb	Хр. 15: 79.98 – 80 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SYNGR1 (англ. Synaptogyrin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 233 амінокислот, а молекулярна маса — 25 456.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEGGAYGAGK		AGGAFDPYTL		VRQPHTILRV		VSWLFSIVVF		GSIVNEGYLN
SASEGEEFCI		YNRNPNACSY		GVAVGVLAFL		TCLLYLALDV		YFPQISSVKD
RKKAVLSDIG		VSAFWAFLWF		VGFCYLANQW		QVSKPKDNPL		NEGTDAARAA
IAFSFFSIFT		WAGQAVLAFQ		RYQIGADSAL		FSQDYMDPSQ		DSSMPYAPYV
EPTGPDPAGM		GGTYQQPANT		FDTEPQGYQS		QGY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cheng M.C., Chen C.H. (2007). Identification of rare mutations of synaptogyrin 1 gene in patients with schizophrenia. J. Psychiatr. Res. 41: 1027—1031. PMID 17049558 DOI:10.1016/j.jpsychires.2006.08.010

Див. також

• Хромосома 22