SYNPO2

SYNPO2
Ідентифікатори
Символи	SYNPO2, synaptopodin 2, SYISL
Зовнішні ІД	MGI: 2153070 HomoloGene: 15400 GeneCards: SYNPO2
Пов'язані генетичні захворювання
бічний аміотрофічний склероз
Онтологія гена Молекулярна функція • 14-3-3 protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • muscle alpha-actinin binding • actin binding • filamin binding • alpha-actinin binding • protein-macromolecule adaptor activity Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела • stress fiber • vesicle tethering complex • цитоскелет • focal adhesion • міжклітинні контакти • actin cytoskeleton • Z disc Біологічний процес • autophagosome assembly • positive regulation of cell migration • positive regulation of actin filament bundle assembly • regulation of Rho-dependent protein serine/threonine kinase activity • chaperone-mediated autophagy Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	171024	118449
Ensembl	ENSG00000172403	ENSMUSG00000050315
UniProt	Q9UMS6	Q91YE8
RefSeq (мРНК)	NM_001128933 NM_001128934 NM_001286754 NM_001286755 NM_133477 NM_001389263 NM_001389264	NM_080451 NM_001388502 NM_001389265 NM_001389266
RefSeq (білок)	NP_001122405 NP_001122406 NP_001273683 NP_001273684 NP_597734	NP_536699 NP_001375431 NP_001376194 NP_001376195
Локус (UCSC)	Хр. 4: 118.85 – 119.06 Mb	Хр. 3: 122.87 – 123.03 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SYNPO2 (англ. Synaptopodin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 093 амінокислот, а молекулярна маса — 117 514.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGTGDFICIS		MTGGAPWGFR		LQGGKEQKQP		LQVAKIRNQS		KASGSGLCEG
DEVVSINGNP		CADLTYPEVI		KLMESITDSL		QMLIKRPSSG		ISEALISENE
NKNLEHLTHG		GYVESTTLQI		RPATKTQCTE		FFLAPVKTEV		PLAENQRSGP
DCAGSLKEET		GPSYQRAPQM		PDSQRGRVAE		ELILREKVEA		VQPGPVVELQ
LSLSQERHKG		ASGPLVALPG		AEKSKSPDPD		PNLSHDRIVH		INSIPTNEKA
DPFLRSSKII		QISSGRELRV		IQESEAGDAG		LPRVEVILDC		SDRQKTEGCR
LQAGKECVDS		PVEGGQSEAP		PSLVSFAVSS		EGTEQGEDPR		SEKDHSRPHK
HRARHARLRR		SESLSEKQVK		EAKSKCKSIA		LLLTDAPNPN		SKGVLMFKKR
RRRARKYTLV		SYGTGELERE		ADEEEEGDKE		DTCEVAFLGA		SESEVDEELL
SDVDDNTQVV		NFDWDSGLVD		IEKKLNRGDK		MEMLPDTTGK		GALMFAKRRE
RMDQITAQKE		EDKVGGTPSR		EQDAAQTDGL		RTTTSYQRKE		EESVRTQSSV
SKSYIEVSHG		LGHVPQQNGF		SGTSETANIQ		RMVPMNRTAK		PFPGSVNQPA
TPFSPTRNMT		SPIADFPAPP		PYSAVTPPPD		AFSRGVSSPI		AGPAQPPPWP
QPAPWSQPAF		YDSSERIASR		DERISVPAKR		TGILQEAKRR		STTKPMFTFK
EPKVSPNPEL		LSLLQNSEGK		RGTGAGGDSG		PEEDYLSLGA		EACNFMQSSS
AKQKTPPPVA		PKPAVKSSSS		QPVTPVSPVW		SPGVAPTQPP		AFPTSNPSKG
TVVSSIKIAQ		PSYPPARPAS		TLNVAGPFKG		PQAAVASQNY		TPKPTVSTPT
VNAVQPGAVG		PSNELPGMSG		RGAQLFAKRQ		SRMEKYVVDS		DTVQAHAARA
QSPTPSLPAS		WKYSSNVRAP		PPVAYNPIHS		PSYPLAALKS		QPSAAQPSKM
GKKKGKKPLN		ALDVMKHQPY		QLNASLFTFQ		PPDAKDGLPQ		KSSVKVNSAL
AMKQALPPRP		VNAASPTNVQ		ASSVYSVPAY		TSPPSFFAEA		SSPVSASPVP
VGIPTSPKQE		SASSSYFVAP		RPKFSAKKSG		VTIQVWKPSV		VEE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до м'язових білків, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, клітинних контактах.

Література

• Kai F., Duncan R. (2013). Prostate cancer cell migration induced by myopodin isoforms is associated with formation of morphologically and biochemically distinct actin networks. FASEB J. 27: 5046—5058. PMID 24005909 DOI:10.1096/fj.13-231571
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yu Y.P., Luo J.H. (2006). Myopodin-mediated suppression of prostate cancer cell migration involves interaction with zyxin. Cancer Res. 66: 7414—7419. PMID 16885336 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-06-0227
• Yu Y.P., Luo J.H. (2011). Phosphorylation and interaction of myopodin by integrin-link kinase lead to suppression of cell growth and motility in prostate cancer cells. Oncogene. 30: 4855—4863. PMID 21643011 DOI:10.1038/onc.2011.200
• Kai F., Tanner K., King C., Duncan R. (2012). Myopodin isoforms alter the chemokinetic response of PC3 cells in response to different migration stimuli via differential effects on Rho-ROCK signaling pathways. Carcinogenesis. 33: 2100—2107. PMID 22915763 DOI:10.1093/carcin/bgs268
• Kai F., Fawcett J.P., Duncan R. (2015). Synaptopodin-2 induces assembly of peripheral actin bundles and immature focal adhesions to promote lamellipodia formation and prostate cancer cell migration. Oncotarget. 6: 11162—11174. PMID 25883213 DOI:10.18632/oncotarget.3578

Див. також

• Хромосома 4