SYNPR

SYNPR
Ідентифікатори
Символи	SYNPR, SPO, synaptoporin
Зовнішні ІД	MGI: 1919253 HomoloGene: 11407 GeneCards: SYNPR
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • syntaxin-1 binding Клітинна компонента • синапс • мембрана • Міжклітинні контакти • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • integral component of synaptic vesicle membrane • synaptic vesicle membrane • neuron projection • integral component of membrane • Синаптичні бульбашки Біологічний процес • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	132204	72003
Ensembl	ENSG00000163630	ENSMUSG00000056296
UniProt	Q8TBG9	Q8BGN8
RefSeq (мРНК)	NM_001130003 NM_144642	NM_001163032 NM_028052
RefSeq (білок)	NP_001123475 NP_653243	NP_001156504 NP_082328
Локус (UCSC)	Хр. 3: 63.23 – 63.62 Mb	Хр. 14: 8.85 – 9.18 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SYNPR (англ. Synaptoporin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 265 амінокислот, а молекулярна маса — 29 166.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MCMVIFAPLF		AIFAFATCGG		YSGGLRLSVD		CVNKTESNLS		IDIAFAYPFR
LHQVTFEVPT		CEGKERQKLA		LIGDSSSSAE		FFVTVAVFAF		LYSLAATVVY
IFFQNKYREN		NRGPLIDFIV		TVVFSFLWLV		GSSAWAKGLS		DVKVATDPKE
VLLLMSACKQ		PSNKCMAIHS		PVMSSLNTSV		VFGFLNFILW		AGNIWFVFKE
TGWHSSGQRY		LSDPMEKHSS		SYNQGGYNQD		SYGSSSGYSQ		QASLGPTSDE
FGQQPTGPTS		FTNQI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах, синаптосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 3