SYNRG

SYNRG
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2MX7
Ідентифікатори
Символи	SYNRG, AP1GBP1, SYNG, synergin, gamma, synergin gamma
Зовнішні ІД	OMIM: 607291 MGI: 1354742 HomoloGene: 105680 GeneCards: SYNRG
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • AP-1 adaptor complex • комплекс Ґольджі • мембрана Біологічний процес • protein transport • intracellular protein transport • ендоцитоз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11276	217030
Ensembl	ENSG00000275066 ENSG00000274047	ENSMUSG00000034940
UniProt	Q9UMZ2	Q5SV85
RefSeq (мРНК)	NM_001163544 NM_001163545 NM_001163546 NM_001163547 NM_007247 NM_080550 NM_198882	NM_001115009 NM_194341
RefSeq (білок)	NP_001157016 NP_001157017 NP_001157018 NP_001157019 NP_009178 NP_542117 NP_942583	NP_919322 NP_001392038 NP_001392041 NP_001392042 NP_001392044 NP_001392045 NP_001392047 NP_001392050 NP_001392051 NP_001392052
Локус (UCSC)	Хр. 17: 37.51 – 37.61 Mb	Хр. 11: 83.86 – 83.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SYNRG (англ. Synergin gamma) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 314 амінокислот, а молекулярна маса — 140 654.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALRPGAGSG		GGGAAGAGAG		SAGGGGFMFP		VAGGIRPPQA		GLMPMQQQGF
PMVSVMQPNM		QGIMGMNYSS		QMSQGPIAMQ		AGIPMGPMPA		AGMPYLGQAP
FLGMRPPGPQ		YTPDMQKQFA		EEQQKRFEQQ		QKLLEEERKR		RQFEEQKQKL
RLLSSVKPKT		GEKSRDDALE		AIKGNLDGFS		RDAKMHPTPA		SHPKKPGPSL
EEKFLVSCDI		STSGQEQIKL		NTSEVGHKAL		GPGSSKKYPS		LMASNGVAVD
GCVSGTTTAE		AENTSDQNLS		IEESGVGVFP		SQDPAQPRMP		PWIYNESLVP
DAYKKILETT		MTPTGIDTAK		LYPILMSSGL		PRETLGQIWA		LANRTTPGKL
TKEELYTVLA		MIAVTQRGVP		AMSPDALNQF		PAAPIPTLSG		FSMTLPTPVS
QPTVIPSGPA		GSMPLSLGQP		VMGINLVGPV		GGAAAQASSG		FIPTYPANQV
VKPEEDDFQD		FQDASKSGSL		DDSFSDFQEL		PASSKTSNSQ		HGNSAPSLLM
PLPGTKALPS		MDKYAVFKGI		AADKSSENTV		PPGDPGDKYS		AFRELEQTAE
NKPLGESFAE		FRSAGTDDGF		TDFKTADSVS		PLEPPTKDKT		FPPSFPSGTI
QQKQQTQVKN		PLNLADLDMF		SSVNCSSEKP		LSFSAVFSTS		KSVSTPQSTG
SAATMTALAA		TKTSSLADDF		GEFSLFGEYS		GLAPVGEQDD		FADFMAFSNS
SISSEQKPDD		KYDALKEEAS		PVPLTSNVGS		TVKGGQNSTA		ASTKYDVFRQ
LSLEGSGLGV		EDLKDNTPSG		KSDDDFADFH		SSKFSSINSD		KSLGEKAVAF
RHTKEDSASV		KSLDLPSIGG		SSVGKEDSED		ALSVQFDMKL		ADVGGDLKHV
MSDSSLDLPT		VSGQHPPAAD		IEDLKYAAFG		SYSSNFAVST		LTSYDWSDRD
DATQGRKLSP		FVLSAGSGSP		SATSILQKKE		TSFGSSENIT		MTSLSKVTTF
VSEDALPETT		FPALASFKDT		IPQTSEQKEY		ENRDYKDFTK		QDLPTAERSQ
EATCPSPASS		GASQETPNEC		SDDFGEFQSE		KPKISKFDFL		VATSQSKMKS
SEEMIKSELA		TFDLSVQGSH		KRSLSLGDKE		ISRSSPSPAL		EQPFRDRSNT
LNEKPALPVI		RDKYKDLTGE		VEENERYAYE		WQRCLGSALN		VIKKANDTLN
GISSSSVCTE		VIQSAQGMEY		LLGVVEVYRV		TKRVELGIKA		TAVCSEKLQQ
LLKDIDKVWN		NLIGFMSLAT		LTPDENSLDF		SSCMLRPGIK		NAQELACGVC
LLNVDSRSRK		EEKPAEEHPK		KAFNSETDSF		KLAYGGHQYH		ASCANFWINC
VEPKPPGLVL		PDLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ендоцитоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, апараті гольджі.

Література

• Page L.J., Sowerby P.J., Lui W.W.Y., Robinson M.S. (1999). Gamma-synergin: an EH domain-containing protein that interacts with gamma-adaptin. J. Cell Biol. 146: 993—1004. PMID 10477754 DOI:10.1083/jcb.146.5.993
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Takatsu H., Yoshino K., Nakayama K. (2000). Adaptor gamma ear homology domain conserved in gamma-adaptin and GGA proteins that interact with gamma-synergin. Biochem. Biophys. Res. Commun. 271: 719—725. PMID 10814529 DOI:10.1006/bbrc.2000.2700

Див. також

• Хромосома 17