SYTL2

SYTL2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3BC1
Ідентифікатори
Символи	SYTL2, CHR11SYT, EXO4, PPP1R151, SGA72M, SLP2, SLP2A, synaptotagmin like 2
Зовнішні ІД	OMIM: 612880 MGI: 1933366 HomoloGene: 131343 GeneCards: SYTL2
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • phosphatase binding • clathrin binding • phosphatidylserine binding • neurexin family protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium-dependent phospholipid binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding • syntaxin binding Клітинна компонента • цитоплазма • exocytic vesicle • мембрана • Меланосома • клітинна мембрана • extrinsic component of plasma membrane • синапс • presynapse Біологічний процес • negative regulation of phosphatase activity • vesicle docking involved in exocytosis • protein localization to plasma membrane • intracellular protein transport • positive regulation of mucus secretion • vesicle-mediated transport • екзоцитоз • regulation of calcium ion-dependent exocytosis • calcium ion-regulated exocytosis of neurotransmitter • vesicle fusion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54843	83671
Ensembl	ENSG00000137501	ENSMUSG00000030616
UniProt	Q9HCH5	Q99N50
RefSeq (мРНК)	NM_001162951 NM_001162952 NM_001162953 NM_001289608 NM_001289609 NM_001289610 NM_032379 NM_032943 NM_206927 NM_206928 NM_206929 NM_206930 NM_001365826 NM_001365827 NM_001365828 NM_001365829 NM_001365830 NM_001365831 NM_001365832 NM_001365833 NM_001365834 NM_001365835	NM_001040085 NM_001040086 NM_001040087 NM_001040088 NM_001289583 NM_001289584 NM_001289585 NM_001289586 NM_031394 NM_001368878
RefSeq (білок)	NP_001156423 NP_001156424 NP_001156425 NP_001276537 NP_001276538 NP_001276539 NP_116561 NP_996812 NP_996813 NP_001352755 NP_001352756 NP_001352757 NP_001352758 NP_001352759 NP_001352760 NP_001352761 NP_001352762 NP_001352763 NP_001352764 NP_996810 NP_996811	NP_001035174 NP_001035176 NP_001035177 NP_001276512 NP_001276513 NP_001276514 NP_001276515 NP_113571 NP_001355807
Локус (UCSC)	Хр. 11: 85.69 – 85.81 Mb	Хр. 7: 89.95 – 90.06 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SYTL2 (англ. Synaptotagmin like 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 934 амінокислот, а молекулярна маса — 104 930.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MIDLSFLTEE		EQEAIMKVLQ		RDAALKRAEE		ERVRHLPEKI		KDDQQLKNMS
GQWFYEAKAK		RHRDKIHGAD		IIRASMRKKR		PQIAAEQSKD		RENGAKESWV
NNVNKDAFLP		PELAGVVEEP		EEDAAPASPS		SSVVNPASSV		IDMSQENTRK
PNVSPEKRKN		PFNSSKLPEG		HSSQQTKNEQ		SKNGRTGLFQ		TSKEDELSES
KEKSTVADTS		IQKLEKSKQT		LPGLSNGSQI		KAPIPKARKM		IYKSTDLNKD
DNQSFPRQRT		DSLKARGAPR		GILKRNSSSS		STDSETLRYN		HNFEPKSKIV
SPGLTIHERI		SEKEHSLEDN		SSPNSLEPLK		HVRFSAVKDE		LPQSPGLIHG
REVGEFSVLE		SDRLKNGMED		AGDTEEFQSD		PKPSQYRKPS		LFHQSTSSPY
VSKSETHQPM		TSGSFPINGL		HSHSEVLTAR		PQSMENSPTI		NEPKDKSSEL
TRLESVLPRS		PADELSHCVE		PEPSQVPGGS		SRDRQQGSEE		EPSPVLKTLE
RSAARKMPSK		SLEDISSDSS		NQAKVDNQPE		ELVRSAEDVS		TVPTQPDNPF
SHPDKLKRMS		KSVPAFLQDE		SDDRETDTAS		ESSYQLSRHK		KSPSSLTNLS
SSSGMTSLSS		VSGSVMSVYS		GDFGNLEVKG		NIQFAIEYVE		SLKELHVFVA
QCKDLAAADV		KKQRSDPYVK		AYLLPDKGKM		GKKKTLVVKK		TLNPVYNEIL
RYKIEKQILK		TQKLNLSIWH		RDTFKRNSFL		GEVELDLETW		DWDNKQNKQL
RWYPLKRKTA		PVALEAENRG		EMKLALQYVP		EPVPGKKLPT		TGEVHIWVKE
CLDLPLLRGS		HLNSFVKCTI		LPDTSRKSRQ		KTRAVGKTTN		PIFNHTMVYD
GFRPEDLMEA		CVELTVWDHY		KLTNQFLGGL		RIGFGTGKSY		GTEVDWMDST
SEEVALWEKM		VNSPNTWIEA		TLPLRMLLIA		KISK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як екзоцитоз, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11