SYVN1

SYVN1
Ідентифікатори
Символи	SYVN1, DER3, HRD1, synoviolin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 608046 MGI: 1921376 HomoloGene: 32700 GeneCards: SYVN1
Онтологія гена Молекулярна функція • chaperone binding • unfolded protein binding • ATPase binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin-specific protease binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • transferase activity Клітинна компонента • integral component of membrane • endoplasmic reticulum membrane • нуклеоплазма • smooth endoplasmic reticulum • integral component of endoplasmic reticulum membrane • endoplasmic reticulum quality control compartment • Derlin-1 retrotranslocation complex • Hrd1p ubiquitin ligase complex • Hrd1p ubiquitin ligase ERAD-L complex • мембрана • ендоплазматичний ретикулум Біологічний процес • protein stabilization • protein K48-linked ubiquitination • retrograde protein transport, ER to cytosol • IRE1-mediated unfolded protein response • negative regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway • protein N-linked glycosylation via asparagine • endoplasmic reticulum mannose trimming • ERAD pathway • Відповідь на незгорнуті білки • ubiquitin-dependent ERAD pathway • Убіквітин-залежний протеоліз • ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84447	74126
Ensembl	ENSG00000162298	ENSMUSG00000024807
UniProt	Q86TM6	Q9DBY1
RefSeq (мРНК)	NM_032431 NM_172230	NM_001164709 NM_028769
RefSeq (білок)	NP_115807 NP_757385	NP_001158181 NP_083045
Локус (UCSC)	Хр. 11: 65.12 – 65.13 Mb	Хр. 19: 6.1 – 6.1 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SYVN1 (англ. Synoviolin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 617 амінокислот, а молекулярна маса — 67 685.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFRTAVMMAA		SLALTGAVVA		HAYYLKHQFY		PTVVYLTKSS		PSMAVLYIQA
FVLVFLLGKV		MGKVFFGQLR		AAEMEHLLER		SWYAVTETCL		AFTVFRDDFS
PRFVALFTLL		LFLKCFHWLA		EDRVDFMERS		PNISWLFHCR		IVSLMFLLGI
LDFLFVSHAY		HSILTRGASV		QLVFGFEYAI		LMTMVLTIFI		KYVLHSVDLQ
SENPWDNKAV		YMLYTELFTG		FIKVLLYMAF		MTIMIKVHTF		PLFAIRPMYL
AMRQFKKAVT		DAIMSRRAIR		NMNTLYPDAT		PEELQAMDNV		CIICREEMVT
GAKRLPCNHI		FHTSCLRSWF		QRQQTCPTCR		MDVLRASLPA		QSPPPPEPAD
QGPPPAPHPP		PLLPQPPNFP		QGLLPPFPPG		MFPLWPPMGP		FPPVPPPPSS
GEAVAPPSTS		AAALSRPSGA		ATTTAAGTSA		TAASATASGP		GSGSAPEAGP
APGFPFPPPW		MGMPLPPPFA		FPPMPVPPAG		FAGLTPEELR		ALEGHERQHL
EARLQSLRNI		HTLLDAAMLQ		INQYLTVLAS		LGPPRPATSV		NSTEETATTV
VAAASSTSIP		SSEATTPTPG		ASPPAPEMER		PPAPESVGTE		EMPEDGEPDA
AELRRRRLQK		LESPVAH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як відповідь на стрес, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• Kaneko M., Ishiguro M., Niinuma Y., Uesugi M., Nomura Y. (2002). Human HRD1 protects against ER stress-induced apoptosis through ER-associated degradation. FEBS Lett. 532: 147—152. PMID 12459480 DOI:10.1016/S0014-5793(02)03660-8
• Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lilley B.N., Ploegh H.L. (2005). Multiprotein complexes that link dislocation, ubiquitination, and extraction of misfolded proteins from the endoplasmic reticulum membrane. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 14296—14301. PMID 16186509 DOI:10.1073/pnas.0505014102
• Arteaga M.F., Wang L., Ravid T., Hochstrasser M., Canessa C.M. (2006). An amphipathic helix targets serum and glucocorticoid-induced kinase 1 to the endoplasmic reticulum-associated ubiquitin-conjugation machinery. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 11178—11183. PMID 16847254 DOI:10.1073/pnas.0604816103
• Christianson J.C., Shaler T.A., Tyler R.E., Kopito R.R. (2008). OS-9 and GRP94 deliver mutant alpha1-antitrypsin to the Hrd1-SEL1L ubiquitin ligase complex for ERAD. Nat. Cell Biol. 10: 272—282. PMID 18264092 DOI:10.1038/ncb1689

Див. також

• Хромосома 11