TBC1D4

TBC1D4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3QYB
Ідентифікатори
Символи	TBC1D4, AS160, NIDDM5, TBC1 domain family member 4
Зовнішні ІД	OMIM: 612465 MGI: 2429660 HomoloGene: 45451 GeneCards: TBC1D4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • система ендомембран • внутрішньоклітинний • цитоплазма • гіалоплазма • везикула Біологічний процес • vesicle-mediated transport • negative regulation of vesicle fusion • cellular response to insulin stimulus • regulation of vesicle fusion • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity • intracellular protein transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9882	210789
Ensembl	ENSG00000136111	ENSMUSG00000033083
UniProt	O60343	Q8BYJ6
RefSeq (мРНК)	NM_001286658 NM_001286659 NM_014832	NM_001081278 NM_173380
RefSeq (білок)	NP_001273587 NP_001273588 NP_055647	NP_001074747 NP_001391600 NP_001391601 NP_001391602 NP_001391603
Локус (UCSC)	Хр. 13: 75.28 – 75.48 Mb	Хр. 14: 101.68 – 101.85 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TBC1D4 (англ. TBC1 domain family member 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 298 амінокислот, а молекулярна маса — 146 563.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEPPSCIQDE		PFPHPLEPEP		GVSAQPGPGK		PSDKRFRLWY		VGGSCLDHRT
TLPMLPWLMA		EIRRRSQKPE		AGGCGAPAAR		EVILVLSAPF		LRCVPAPGAG
ASGGTSPSAT		QPNPAVFIFE		HKAQHISRFI		HNSHDLTYFA		YLIKAQPDDP
ESQMACHVFR		ATDPSQVPDV		ISSIRQLSKA		AMKEDAKPSK		DNEDAFYNSQ
KFEVLYCGKV		TVTHKKAPSS		LIDDCMEKFS		LHEQQRLKIQ		GEQRGPDPGE
DLADLEVVVP		GSPGDCLPEE		ADGTDTHLGL		PAGASQPALT		SSRVCFPERI
LEDSGFDEQQ		EFRSRCSSVT		GVQRRVHEGS		QKSQPRRRHA		SAPSHVQPSD
SEKNRTMLFQ		VGRFEINLIS		PDTKSVVLEK		NFKDISSCSQ		GIKHVDHFGF
ICRESPEPGL		SQYICYVFQC		ASESLVDEVM		LTLKQAFSTA		AALQSAKTQI
KLCEACPMHS		LHKLCERIEG		LYPPRAKLVI		QRHLSSLTDN		EQADIFERVQ
KMKPVSDQEE		NELVILHLRQ		LCEAKQKTHV		HIGEGPSTIS		NSTIPENATS
SGRFKLDILK		NKAKRSLTSS		LENIFSRGAN		RMRGRLGSVD		SFERSNSLAS
EKDYSPGDSP		PGTPPASPPS		SAWQTFPEED		SDSPQFRRRA		HTFSHPPSST
KRKLNLQDGR		AQGVRSPLLR		QSSSEQCSNL		SSVRRMYKES		NSSSSLPSLH
TSFSAPSFTA		PSFLKSFYQN		SGRLSPQYEN		EIRQDTASES		SDGEGRKRTS
STCSNESLSV		GGTSVTPRRI		SWRQRIFLRV		ASPMNKSPSA		MQQQDGLDRN
ELLPLSPLSP		TMEEEPLVVF		LSGEDDPEKI		EERKKSKELR		SLWRKAIHQQ
ILLLRMEKEN		QKLEASRDEL		QSRKVKLDYE		EVGACQKEVL		ITWDKKLLNC
RAKIRCDMED		IHTLLKEGVP		KSRRGEIWQF		LALQYRLRHR		LPNKQQPPDI
SYKELLKQLT		AQQHAILVDL		GRTFPTHPYF		SVQLGPGQLS		LFNLLKAYSL
LDKEVGYCQG		ISFVAGVLLL		HMSEEQAFEM		LKFLMYDLGF		RKQYRPDMMS
LQIQMYQLSR		LLHDYHRDLY		NHLEENEISP		SLYAAPWFLT		LFASQFSLGF
VARVFDIIFL		QGTEVIFKVA		LSLLSSQETL		IMECESFENI		VEFLKNTLPD
MNTSEMEKII		TQVFEMDISK		QLHAYEVEYH		VLQDELQESS		YSCEDSETLE
KLERANSQLK		RQNMDLLEKL		QVAHTKIQAL		ESNLENLLTR		ETKMKSLIRT
LEQEKMAYQK		TVEQLRKLLP		ADALVNCDLL		LRDLNCNPNN		KAKIGNKP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Ishibashi K., Kanno E., Itoh T., Fukuda M. (2009). Identification and characterization of a novel Tre-2/Bub2/Cdc16 (TBC) protein that possesses Rab3A-GAP activity. Genes Cells. 14: 41—52. PMID 19077034 DOI:10.1111/j.1365-2443.2008.01251.x
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Park S.Y., Jin W., Woo J.R., Shoelson S.E. (2011). Crystal structures of human TBC1D1 and TBC1D4 (AS160) RabGTPase-activating protein (RabGAP) domains reveal critical elements for GLUT4 translocation. J. Biol. Chem. 286: 18130—18138. PMID 21454505 DOI:10.1074/jbc.M110.217323

Див. також

• Хромосома 13