TBCD

TBCD
Ідентифікатори
Символи	TBCD, SSD-1, tfcD, tubulin folding cofactor D, PEBAT
Зовнішні ІД	OMIM: 604649 MGI: 1919686 HomoloGene: 4368 GeneCards: TBCD
Онтологія гена Молекулярна функція • chaperone binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • beta-tubulin binding Клітинна компонента • цитоплазма • lateral plasma membrane • мембрана • bicellular tight junction • Адгезивні контакти • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • мікротрубочка • центросома • центр організації мікротрубочок • цитоскелет Біологічний процес • negative regulation of cell-substrate adhesion • negative regulation of microtubule polymerization • adherens junction assembly • згортання білків • bicellular tight junction assembly • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • post-chaperonin tubulin folding pathway • GO:0007067 мітоз • cell morphogenesis involved in neuron differentiation • tubulin complex assembly • microtubule cytoskeleton organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6904	108903
Ensembl	ENSG00000278759 ENSG00000141556	ENSMUSG00000039230
UniProt	Q9BTW9	Q8BYA0
RefSeq (мРНК)	NM_001033052 NM_005993	NM_029878
RefSeq (білок)	NP_005984	NP_084154
Локус (UCSC)	Хр. 17: 82.75 – 82.95 Mb	Хр. 11: 121.34 – 121.51 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TBCD (англ. Tubulin folding cofactor D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 192 амінокислот, а молекулярна маса — 132 600.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALSDEPAAG		GPEEEAEDET		LAFGAALEAF		GESAETRALL		GRLREVHGGG
AEREVALERF		RVIMDKYQEQ		PHLLDPHLEW		MMNLLLDIVQ		DQTSPASLVH
LAFKFLYIIT		KVRGYKTFLR		LFPHEVADVE		PVLDLVTIQN		PKDHEAWETR
YMLLLWLSVT		CLIPFDFSRL		DGNLLTQPGQ		ARMSIMDRIL		QIAESYLIVS
DKARDAAAVL		VSRFITRPDV		KQSKMAEFLD		WSLCNLARSS		FQTMQGVITM
DGTLQALAQI		FKHGKREDCL		PYAATVLRCL		DGCRLPESNQ		TLLRKLGVKL
VQRLGLTFLK		PKVAAWRYQR		GCRSLAANLQ		LLTQGQSEQK		PLILTEDDDE
DDDVPEGVER		VIEQLLVGLK		DKDTVVRWSA		AKGIGRMAGR		LPRALADDVV
GSVLDCFSFQ		ETDKAWHGGC		LALAELGRRG		LLLPSRLVDV		VAVILKALTY
DEKRGACSVG		TNVRDAACYV		CWAFARAYEP		QELKPFVTAI		SSALVIAAVF
DRDINCRRAA		SAAFQENVGR		QGTFPHGIDI		LTTADYFAVG		NRSNCFLVIS
VFIAGFPEYT		QPMIDHLVTM		KISHWDGVIR		ELAARALHNL		AQQAPEFSAT
QVFPRLLSMT		LSPDLHMRHG		SILACAEVAY		ALYKLAAQEN		RPVTDHLDEQ
AVQGLKQIHQ		QLYDRQLYRG		LGGQLMRQAV		CVLIEKLSLS		KMPFRGDTVI
DGWQWLINDT		LRHLHLISSH		SRQQMKDAAV		SALAALCSEY		YMKEPGEADP
AIQEELITQY		LAELRNPEEM		TRCGFSLALG		ALPGFLLKGR		LQQVLTGLRA
VTHTSPEDVS		FAESRRDGLK		AIARICQTVG		VKAGAPDEAV		CGENVSQIYC
ALLGCMDDYT		TDSRGDVGTW		VRKAAMTSLM		DLTLLLARSQ		PELIEAHTCE
RIMCCVAQQA		SEKIDRFRAH		AASVFLTLLH		FDSPPIPHVP		HRGELEKLFP
RSDVASVNWS		APSQAFPRIT		QLLGLPTYRY		HVLLGLVVSL		GGLTESTIRH
STQSLFEYMK		GIQSDPQALG		SFSGTLLQIF		EDNLLNERVS		VPLLKTLDHV
LTHGCFDIFT		TEEDHPFAVK		LLALCKKEIK		NSKDIQKLLS		GIAVFCEMVQ
FPGDVRRQAL		LQLCLLLCHR		FPLIRKTTAS		QVYETLLTYS		DVVGADVLDE
VVTVLSDTAW		DAELAVVREQ		RNRLCDLLGV		PRPQLVPQPG		AC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до шаперонів, активаторів гтфаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Martin L., Fanarraga M.L., Aloria K., Zabala J.C. (2000). Tubulin folding cofactor D is a microtubule destabilizing protein. FEBS Lett. 470: 93—95. PMID 10722852 DOI:10.1016/S0014-5793(00)01293-X
• Bhamidipati A., Lewis S.A., Cowan N.J. (2000). ADP ribosylation factor-like protein 2 (Arl2) regulates the interaction of tubulin-folding cofactor D with native tubulin. J. Cell Biol. 149: 1087—1096. PMID 10831612 DOI:10.1083/jcb.149.5.1087
• Tian G., Thomas S., Cowan N.J. (2010). Effect of TBCD and its regulatory interactor Arl2 on tubulin and microtubule integrity. Cytoskeleton. 67: 706—714. PMID 20740604 DOI:10.1002/cm.20480

Див. також

• Хромосома 17