TDRKH

TDRKH
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DIQ, 3FDR, 5J39
Ідентифікатори
Символи	TDRKH, TDRD2, tudor and KH domain containing
Зовнішні ІД	OMIM: 609501 MGI: 1919884 HomoloGene: 4999 GeneCards: TDRKH
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA binding • nucleic acid binding Клітинна компонента • цитоплазма • pi-body • мітохондрія • piP-body Біологічний процес • male meiotic nuclear division • запліднення • диференціація клітин • DNA methylation involved in gamete generation • Сперматогенез • Сайленсинг генів • piRNA metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11022	72634
Ensembl	ENSG00000182134	ENSMUSG00000041912
UniProt	Q9Y2W6	Q80VL1
RefSeq (мРНК)	NM_001083963 NM_001083964 NM_001083965 NM_006862	NM_028307 NM_001357711 NM_001357712 NM_001357713 NM_001357714
RefSeq (білок)	NP_001077432 NP_001077433 NP_001077434 NP_006853	NP_082583 NP_001344640 NP_001344641 NP_001344642 NP_001344643
Локус (UCSC)	Хр. 1: 151.77 – 151.79 Mb	Хр. 3: 94.32 – 94.34 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TDRKH (англ. Tudor and KH domain containing) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 561 амінокислот, а молекулярна маса — 62 046.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSTERTSWTS		LSTIQKIALG		LGIPASATVA		YILYRRYRES		REERLTFVGE
DDIEIEMRVP		QEAVKLIIGR		QGANIKQLRK		QTGARIDVDT		EDVGDERVLL
ISGFPVQVCK		AKAAIHQILT		ENTPVSEQLS		VPQRSVGRII		GRGGETIRSI
CKASGAKITC		DKESEGTLLL		SRLIKISGTQ		KEVAAAKHLI		LEKVSEDEEL
RKRIAHSAET		RVPRKQPISV		RREDMTEPGG		AGEPALWKNT		SSSMEPTAPL
VTPPPKGGGD		MAVVVSKEGS		WEKPSDDSFQ		KSEAQAIPEM		PMFEIPSPDF
SFHADEYLEV		YVSASEHPNH		FWIQIVGSRS		LQLDKLVNEM		TQHYENSVPE
DLTVHVGDIV		AAPLPTNGSW		YRARVLGTLE		NGNLDLYFVD		FGDNGDCPLK
DLRALRSDFL		SLPFQAIECS		LARIAPSGDQ		WEEEALDEFD		RLTHCADWKP
LVAKISSYVQ		TGISTWPKIY		LYDTSNGKKL		DIGLELVHKG		YAIELPEDIE
ENRAVPDMLK		DMATETDASL		STLLTETKKS		SGEITHTLSC		LSLSEAASMS
GDDNLEDDYL		L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як диференціація, сперматогенез, РНК-залежне заглушення генів, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1