THSD4

THSD4
Ідентифікатори
Символи	THSD4, ADAMTSL-6, ADAMTSL6, FVSY9334, PRO34005, thrombospondin type 1 domain containing 4, AAT12
Зовнішні ІД	OMIM: 614476 MGI: 2672033 HomoloGene: 49796 GeneCards: THSD4
Пов'язані генетичні захворювання
періодонтит
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • extracellular matrix structural constituent Клітинна компонента • microfibril • extracellular region • екзосома • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • elastic fiber assembly • протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79875	207596
Ensembl	ENSG00000187720	ENSMUSG00000032289
UniProt	Q6ZMP0	Q3UTY6
RefSeq (мРНК)	NM_001286429 NM_024817 NM_001394532	NM_001040426 NM_172444
RefSeq (білок)	NP_001273358 NP_079093	NP_001035516 NP_766032
Локус (UCSC)	Хр. 15: 71.1 – 71.78 Mb	Хр. 9: 59.87 – 60.43 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

THSD4 (англ. Thrombospondin type 1 domain containing 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 15-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 018 амінокислот, а молекулярна маса — 112 450.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVSHFMGSLS		VLCFLLLLGF		QFVCPQPSTQ		HRKVPQRMAA		EGAPEDDGGG
GAPGVWGAWG		PWSACSRSCS		GGVMEQTRPC		LPRSYRLRGG		QRPGAPARAF
ADHVVSAVRT		SVPLHRSRDE		TPALAGTDAS		RQGPTVLRGS		RHPQPQGLEV
TGDRRSRTRG		TIGPGKYGYG		KAPYILPLQT		DTAHTPQRLR		RQKLSSRHSR
SQGASSARHG		YSSPAHQVPQ		HGPLYQSDSG		PRSGLQAAEA		PIYQLPLTHD
QGYPAASSLF		HSPETSNNHG		VGTHGATQSF		SQPARSTAIS		CIGAYRQYKL
CNTNVCPESS		RSIREVQCAS		YNNKPFMGRF		YEWEPFAEVK		GNRKCELNCQ
AMGYRFYVRQ		AEKVIDGTPC		DQNGTAICVS		GQCKSIGCDD		YLGSDKVVDK
CGVCGGDNTG		CQVVSGVFKH		ALTSLGYHRV		VEIPEGATKI		NITEMYKSNN
YLALRSRSGR		SIINGNWAID		RPGKYEGGGT		MFTYKRPNEI		SSTAGESFLA
EGPTNEILDV		YMIHQQPNPG		VHYEYVIMGT		NAISPQVPPH		RRPGEPFNGQ
MVTEGRSQEE		GEQKGRNEEK		EDLRGEAPEM		FTSESAQTFP		VRHPDRFSPH
RPDNLVPPAP		QPPRRSRDHN		WKQLGTTECS		TTCGKGSQYP		IFRCVHRSTH
EEAPESYCDS		SMKPTPEEEP		CNIFPCPAFW		DIGEWSECSK		TCGLGMQHRQ
VLCRQVYANR		SLTVQPYRCQ		HLEKPETTST		CQLKICSEWQ		IRTDWTSCSV
PCGVGQRTRD		VKCVSNIGDV		VDDEECNMKL		RPNDIENCDM		GPCAKSWFLT
EWSERCSAEC		GAGVRTRSVV		CMTNHVSSLP		LEGCGNNRPA		EATPCDNGPC
TGKVEWFAGS		WSQCSIECGS		GTQQREVICV		RKNADTFEVL		DPSECSFLEK
PPSQQSCHLK		PCGAKWFSTE		WSMCSKSCQG		GFRVREVRCL		SDDMTLSNLC
DPQLKPEERE		SCNPQDCVPE		VDENCKDKYY		NCNVVVQARL		CVYNYYKTAC
CASCTRVANR		QTGFLGSR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 15