TIAM1

TIAM1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2D8I, 3KZD, 3KZE, 4GVC, 4GVD, 4K2O, 4K2P, 4NXP, 4NXQ, 4NXR
Ідентифікатори
Символи	TIAM1, T-cell lymphoma invasion and metastasis-inducing protein 1, T-cell lymphoma invasion and metastasis 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600687 MGI: 103306 HomoloGene: 2443 GeneCards: TIAM1
Онтологія гена Молекулярна функція • microtubule binding • kinase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • lipid binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity • receptor tyrosine kinase binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • cell-cell junction • cell-cell contact zone • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane • клітинна мембрана • dendritic spine • axonal growth cone • синапс • main axon • ruffle membrane • міжклітинні контакти • neuronal cell body • somatodendritic compartment • мікротрубочка • клітинне ядро • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • glutamatergic synapse • extrinsic component of postsynaptic density membrane Біологічний процес • protein localization to membrane • GO:0097285 апоптоз • regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus • GO:0007243 intracellular signal transduction • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity • positive regulation of JUN kinase activity • ephrin receptor signaling pathway • cardiac muscle hypertrophy • regulation of non-canonical Wnt signaling pathway • positive regulation of axonogenesis • neuron projection extension • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • regulation of dopaminergic neuron differentiation • regulation of ERK1 and ERK2 cascade • positive regulation of neuron projection development • positive regulation of apoptotic process • positive regulation of Schwann cell chemotaxis • positive regulation of protein binding • cell-matrix adhesion • Rac protein signal transduction • regulation of Rho protein signal transduction • regulation of small GTPase mediated signal transduction • cell migration • positive regulation of dendritic spine morphogenesis • GO:0072468 сигнальна трансдукція • response to cocaine • positive regulation of cell population proliferation • positive regulation of cell migration • NMDA selective glutamate receptor signaling pathway • regulation of modification of postsynaptic actin cytoskeleton • regulation of epithelial to mesenchymal transition • positive regulation of epithelial to mesenchymal transition • G protein-coupled receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7074	21844
Ensembl	ENSG00000156299	ENSMUSG00000002489
UniProt	Q13009	Q60610
RefSeq (мРНК)	NM_003253	NM_001145886 NM_001145887 NM_009384
RefSeq (білок)	NP_003244 NP_001340613 NP_001340614 NP_001340615 NP_001340616 NP_001340617 NP_001340618 NP_001340619 NP_001340620 NP_001340621 NP_001340622 NP_001340623	н/д
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 16: 89.58 – 89.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TIAM1 (англ. T-cell lymphoma invasion and metastasis 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 591 амінокислот, а молекулярна маса — 177 508.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGNAESQHVE		HEFYGEKHAS		LGRKHTSRSL		RLSHKTRRTR		HASSGKVIHR
NSEVSTRSSS		TPSIPQSLAE		NGLEPFSQDG		TLEDFGSPIW		VDRVDMGLRP
VSYTDSSVTP		SVDSSIVLTA		ASVQSMPDTE		ESRLYGDDAT		YLAEGGRRQH
SYTSNGPTFM		ETASFKKKRS		KSADIWREDS		LEFSLSDLSQ		EHLTSNEEIL
GSAEEKDCEE		ARGMETRASP		RQLSTCQRAN		SLGDLYAQKN		SGVTANGGPG
SKFAGYCRNL		VSDIPNLANH		KMPPAAAEET		PPYSNYNTLP		CRKSHCLSEG
ATNPQISHSN		SMQGRRAKTT		QDVNAGEGSE		FADSGIEGAT		TDTDLLSRRS
NATNSSYSPT		TGRAFVGSDS		GSSSTGDAAR		QGVYENFRRE		LEMSTTNSES
LEEAGSAHSD		EQSSGTLSSP		GQSDILLTAA		QGTVRKAGAL		AVKNFLVHKK
NKKVESATRR		KWKHYWVSLK		GCTLFFYESD		GRSGIDHNSI		PKHAVWVENS
IVQAVPEHPK		KDFVFCLSNS		LGDAFLFQTT		SQTELENWIT		AIHSACATAV
ARHHHKEDTL		RLLKSEIKKL		EQKIDMDEKM		KKMGEMQLSS		VTDSKKKKTI
LDQIFVWEQN		LEQFQMDLFR		FRCYLASLQG		GELPNPKRLL		AFASRPTKVA
MGRLGIFSVS		SFHALVAART		GETGVRRRTQ		AMSRSASKRR		SRFSSLWGLD
TTSKKKQGRP		SINQVFGEGT		EAVKKSLEGI		FDDIVPDGKR		EKEVVLPNVH
QHNPDCDIWV		HEYFTPSWFC		LPNNQPALTV		VRPGDTARDT		LELICKTHQL
DHSAHYLRLK		FLIENKMQLY		VPQPEEDIYE		LLYKEIEICP		KVTQSIHIEK
SDTAADTYGF		SLSSVEEDGI		RRLYVNSVKE		TGLASKKGLK		AGDEILEINN
RAADALNSSM		LKDFLSQPSL		GLLVRTYPEL		EEGVELLESP		PHRVDGPADL
GESPLAFLTS		NPGHSLCSEQ		GSSAETAPEE		TEGPDLESSD		ETDHSSKSTE
QVAAFCRSLH		EMNPSDQSPS		PQDSTGPQLA		TMRQLSDADK		LRKVICELLE
TERTYVKDLN		CLMERYLKPL		QKETFLTQDE		LDVLFGNLTE		MVEFQVEFLK
TLEDGVRLVP		DLEKLEKVDQ		FKKVLFSLGG		SFLYYADRFK		LYSAFCASHT
KVPKVLVKAK		TDTAFKAFLD		AQNPKQQHSS		TLESYLIKPI		QRILKYPLLL
RELFALTDAE		SEEHYHLDVA		IKTMNKVASH		INEMQKIHEE		FGAVFDQLIA
EQTGEKKEVA		DLSMGDLLLH		TTVIWLNPPA		SLGKWKKEPE		LAAFVFKTAV
VLVYKDGSKQ		KKKLVGSHRL		SIYEDWDPFR		FRHMIPTEAL		QVRALASADA
EANAVCEIVH		VKSESEGRPE		RVFHLCCSSP		ESRKDFLKAV		HSILRDKHRR
QLLKTESLPS		SQQYVPFGGK		RLCALKGARP		AMSRAVSAPS		KSLGRRRRRL
ARNRFTIDSD		AVSASSPEKE		SQQPPGGGDT		DRWVEEQFDL		AQYEEQDDIK
ETDILSDDDE		FCESVKGASV		DRDLQERLQA		TSISQRERGR		KTLDSHASRM
AQLKKQAALS		GINGGLESAS		EEVIWVRRED		FAPSRKLNTE		I

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Michiels F., Habets G.G.M., Stam J.C., van der Kammen R.A., Collard J.G. (1995). A role for Rac in Tiam1-induced membrane ruffling and invasion. Nature. 375: 338—340. PMID 7753201 DOI:10.1038/375338a0
• Connolly B.A., Rice J., Feig L.A., Buchsbaum R.J. (2005). Tiam1-IRSp53 complex formation directs specificity of rac-mediated actin cytoskeleton regulation. Mol. Cell. Biol. 25: 4602—4614. PMID 15899863 DOI:10.1128/MCB.25.11.4602-4614.2005
• Yoo S., Shin J., Park S. (2010). EphA8-ephrinA5 signaling and clathrin-mediated endocytosis is regulated by Tiam-1, a Rac-specific guanine nucleotide exchange factor. Mol. Cells. 29: 603—609. PMID 20496116 DOI:10.1007/s10059-010-0075-2
• Joshi M., Gakhar L., Fuentes E.J. (2013). High-resolution structure of the Tiam1 PHn-CC-Ex domain. Acta Crystallogr. F. 69: 744—752. PMID 23832200 DOI:10.1107/S1744309113014206
• Liu X., Shepherd T.R., Murray A.M., Xu Z., Fuentes E.J. (2013). The structure of the Tiam1 PDZ domain/ phospho-syndecan1 complex reveals a ligand conformation that modulates protein dynamics. Structure. 21: 342—354. PMID 23395182 DOI:10.1016/j.str.2013.01.004

Див. також

• Хромосома 21