TIMD4

TIMD4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5F7H, 5DZN, 5F7F
Ідентифікатори
Символи	TIMD4, SMUCKLER, TIM4, T-cell immunoglobulin and mucin domain containing 4, T cell immunoglobulin and mucin domain containing 4
Зовнішні ІД	OMIM: 610096 MGI: 2445125 HomoloGene: 51381 GeneCards: TIMD4
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	91937	276891
Ensembl	ENSG00000145850	ENSMUSG00000055546
UniProt	Q96H15	Q6U7R4
RefSeq (мРНК)	NM_001146726 NM_138379	NM_178759
RefSeq (білок)	NP_001140198 NP_612388	NP_848874
Локус (UCSC)	Хр. 5: 156.92 – 156.96 Mb	Хр. 11: 46.7 – 46.74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TIMD4 (англ. T-cell immunoglobulin and mucin domain containing 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 378 амінокислот, а молекулярна маса — 41 578.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSKEPLILWL		MIEFWWLYLT		PVTSETVVTE		VLGHRVTLPC		LYSSWSHNSN
SMCWGKDQCP		YSGCKEALIR		TDGMRVTSRK		SAKYRLQGTI		PRGDVSLTIL
NPSESDSGVY		CCRIEVPGWF		NDVKINVRLN		LQRASTTTHR		TATTTTRRTT
TTSPTTTRQM		TTTPAALPTT		VVTTPDLTTG		TPLQMTTIAV		FTTANTCLSL
TPSTLPEEAT		GLLTPEPSKE		GPILTAESET		VLPSDSWSSV		ESTSADTVLL
TSKESKVWDL		PSTSHVSMWK		TSDSVSSPQP		GASDTAVPEQ		NKTTKTGQMD
GIPMSMKNEM		PISQLLMIIA		PSLGFVLFAL		FVAFLLRGKL		METYCSQKHT
RLDYIGDSKN		VLNDVQHGRE		DEDGLFTL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5