TINAGL1

TINAGL1
Ідентифікатори
Символи	TINAGL1, ARG1, LCN7, LIECG3, TINAGRP, tubulointerstitial nephritis antigen like 1
Зовнішні ІД	OMIM: 616064 MGI: 2137617 HomoloGene: 41472 GeneCards: TINAGL1
Онтологія гена Молекулярна функція • scavenger receptor activity • polysaccharide binding • cysteine-type endopeptidase activity • laminin binding • extracellular matrix structural constituent • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cysteine-type peptidase activity Клітинна компонента • цитоплазма • GO:0005578 Позаклітинна матриця • extracellular region • лізосома • екзосома • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • endosomal transport • адгезія клітин • proteolysis involved in cellular protein catabolic process • рецептор-опосередкований ендоцитоз • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • протеоліз • ендоцитоз Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64129	94242
Ensembl	ENSG00000142910	ENSMUSG00000028776
UniProt	Q9GZM7	Q99JR5
RefSeq (мРНК)	NM_001204414 NM_001204415 NM_022164	NM_001168333 NM_023476
RefSeq (білок)	NP_001191343 NP_001191344 NP_071447	NP_001161805 NP_075965
Локус (UCSC)	Хр. 1: 31.58 – 31.59 Mb	Хр. 4: 130.06 – 130.07 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TINAGL1 (англ. Tubulointerstitial nephritis antigen like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 467 амінокислот, а молекулярна маса — 52 387.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWRCPLGLLL		LLPLAGHLAL		GAQQGRGRRE		LAPGLHLRGI		RDAGGRYCQE
QDLCCRGRAD		DCALPYLGAI		CYCDLFCNRT		VSDCCPDFWD		FCLGVPPPFP
PIQGCMHGGR		IYPVLGTYWD		NCNRCTCQEN		RQWQCDQEPC		LVDPDMIKAI
NQGNYGWQAG		NHSAFWGMTL		DEGIRYRLGT		IRPSSSVMNM		HEIYTVLNPG
EVLPTAFEAS		EKWPNLIHEP		LDQGNCAGSW		AFSTAAVASD		RVSIHSLGHM
TPVLSPQNLL		SCDTHQQQGC		RGGRLDGAWW		FLRRRGVVSD		HCYPFSGRER
DEAGPAPPCM		MHSRAMGRGK		RQATAHCPNS		YVNNNDIYQV		TPVYRLGSND
KEIMKELMEN		GPVQALMEVH		EDFFLYKGGI		YSHTPVSLGR		PERYRRHGTH
SVKITGWGEE		TLPDGRTLKY		WTAANSWGPA		WGERGHFRIV		RGVNECDIES
FVLGVWGRVG		MEDMGHH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504

Див. також

• Хромосома 1