TMEFF1

TMEFF1
Ідентифікатори
Символи	TMEFF1, C9orf2, CT120.1, H7365, TR-1, transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603421 MGI: 1926810 HomoloGene: 130458 GeneCards: TMEFF1
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8577	230157
Ensembl	ENSG00000241697	ENSMUSG00000028347
UniProt	Q8IYR6	Q6PFE7
RefSeq (мРНК)	NM_003692	NM_021436 NM_001356272
RefSeq (білок)	NP_001185741	NP_067411 NP_001343201
Локус (UCSC)	Хр. 9: 100.47 – 100.58 Mb	Хр. 4: 48.59 – 48.66 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TMEFF1 (англ. MSANTD3-TMEFF1 readthrough) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 9-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 380 амінокислот, а молекулярна маса — 40 934.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGAAAAEAPL		RLPAAPPLAF		CCYTSVLLLF		AFSLPGSRAS		NQPPGGGGGS
GGDCPGGKGK		SINCSELNVR		ESDVRVCDES		SCKYGGVCKE		DGDGLKCACQ
FQCHTNYIPV		CGSNGDTYQN		ECFLRRAACK		HQKEITVIAR		GPCYSDNGSG
SGEGEEEGSG		AEVHRKHSKC		GPCKYKAECD		EDAENVGCVC		NIDCSGYSFN
PVCASDGSSY		NNPCFVREAS		CIKQEQIDIR		HLGHCTDTDD		TSLLGKKDDG
LQYRPDVKDA		SDQREDVYIG		NHMPCPENLN		GYCIHGKCEF		IYSTQKASCR
CESGYTGQHC		EKTDFSILYV		VPSRQKLTHV		LIAAIIGAVQ		IAIIVAIVMC
ITRKCPKNNR		GRRQKQNLGH		FTSDTSSRMV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Gery S., Yin D., Xie D., Black K.L., Koeffler H.P. (2003). TMEFF1 and brain tumors. Oncogene. 22: 2723—2727. PMID 12743596 DOI:10.1038/sj.onc.1206351
• Ge W., Hu H., Ding K., Sun L., Zheng S. (2006). Protein interaction analysis of ST14 domains and their point and deletion mutants. J. Biol. Chem. 281: 7406—7412. PMID 16407223 DOI:10.1074/jbc.M510687200
• Eib D.W., Martens G.J.M. (1996). A novel transmembrane protein with epidermal growth factor and follistatin domains expressed in the hypothalamo-hypophysial axis of Xenopus laevis. J. Neurochem. 67: 1047—1055. PMID 8752111

Див. також

• Хромосома 9