TMEFF2

TMEFF2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2FMW
Ідентифікатори
Символи	TMEFF2, CT120.2, HPP1, TENB2, TPEF, TR, TR-2, transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2
Зовнішні ІД	OMIM: 605734 MGI: 1861735 HomoloGene: 9417 GeneCards: TMEFF2
Онтологія гена Молекулярна функція • молекулярна функція Клітинна компонента • integral component of membrane • extracellular region • мембрана • клітинна мембрана Біологічний процес • negative regulation of integrin biosynthetic process • negative regulation of cell migration • negative regulation of stress fiber assembly • wound healing, spreading of cells • animal organ morphogenesis • гістогенез Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23671	56363
Ensembl	ENSG00000144339	ENSMUSG00000026109
UniProt	Q9UIK5	Q9QYM9
RefSeq (мРНК)	NM_001305134 NM_001305145 NM_016192	NM_019790
RefSeq (білок)	NP_001292063 NP_001292074 NP_057276	NP_062764
Локус (UCSC)	Хр. 2: 191.95 – 192.19 Mb	Хр. 1: 50.94 – 51.23 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TMEFF2 (англ. Transmembrane protein with EGF like and two follistatin like domains 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 374 амінокислот, а молекулярна маса — 41 428.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVLWESPRQC		SSWTLCEGFC		WLLLLPVMLL		IVARPVKLAA		FPTSLSDCQT
PTGWNCSGYD		DRENDLFLCD		TNTCKFDGEC		LRIGDTVTCV		CQFKCNNDYV
PVCGSNGESY		QNECYLRQAA		CKQQSEILVV		SEGSCATDAG		SGSGDGVHEG
SGETSQKETS		TCDICQFGAE		CDEDAEDVWC		VCNIDCSQTN		FNPLCASDGK
SYDNACQIKE		ASCQKQEKIE		VMSLGRCQDN		TTTTTKSEDG		HYARTDYAEN
ANKLEESARE		HHIPCPEHYN		GFCMHGKCEH		SINMQEPSCR		CDAGYTGQHC
EKKDYSVLYV		VPGPVRFQYV		LIAAVIGTIQ		IAVICVVVLC		ITRKCPRSNR
IHRQKQNTGH		YSSDNTTRAS		TRLI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Quayle S.N., Sadar M.D. (2006). A truncated isoform of TMEFF2 encodes a secreted protein in prostate cancer cells. Genomics. 87: 633—637. PMID 16439095 DOI:10.1016/j.ygeno.2005.12.004
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
• Siegel D.A., Davies P., Dobrenis K., Huang M. (2006). Tomoregulin-2 is found extensively in plaques in Alzheimer's disease brain. J. Neurochem. 98: 34—44. PMID 16805794 DOI:10.1111/j.1471-4159.2006.03801.x
• Ali N., Knaeuper V. (2007). Phorbol ester-induced shedding of the prostate cancer marker transmembrane protein with epidermal growth factor and two follistatin motifs 2 is mediated by the disintegrin and metalloproteinase-17. J. Biol. Chem. 282: 37378—37388. PMID 17942404 DOI:10.1074/jbc.M702170200
• Liang G., Robertson K.D., Talmadge C., Sumegi J., Jones P.A. (2000). The gene for a novel transmembrane protein containing epidermal growth factor and follistatin domains is frequently hypermethylated in human tumor cells. Cancer Res. 60: 4907—4912. PMID 10987305

Див. також

• Хромосома 2