TNFAIP6

TNFAIP6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1O7B, 1O7C, 2PF5, 2WNO, 2N40
Ідентифікатори
Символи	TNFAIP6, TSG-6, TSG6, TNF alpha induced protein 6
Зовнішні ІД	OMIM: 600410 MGI: 1195266 HomoloGene: 5162 GeneCards: TNFAIP6
Онтологія гена Молекулярна функція • hyaluronic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • extracellular region • міжклітинний простір • tertiary granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen Біологічний процес • cell-cell signaling • адгезія клітин • inflammatory response • negative regulation of inflammatory response • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of cell migration • овуляція • neutrophil degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7130	21930
Ensembl	ENSG00000123610	ENSMUSG00000053475
UniProt	P98066	O08859
RefSeq (мРНК)	NM_007115	NM_009398
RefSeq (білок)	NP_009046	NP_033424
Локус (UCSC)	Хр. 2: 151.36 – 151.38 Mb	Хр. 2: 51.93 – 51.95 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TNFAIP6 (англ. TNF alpha induced protein 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 277 амінокислот, а молекулярна маса — 31 203.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MIILIYLFLL		LWEDTQGWGF		KDGIFHNSIW		LERAAGVYHR		EARSGKYKLT
YAEAKAVCEF		EGGHLATYKQ		LEAARKIGFH		VCAAGWMAKG		RVGYPIVKPG
PNCGFGKTGI		IDYGIRLNRS		ERWDAYCYNP		HAKECGGVFT		DPKQIFKSPG
FPNEYEDNQI		CYWHIRLKYG		QRIHLSFLDF		DLEDDPGCLA		DYVEIYDSYD
DVHGFVGRYC		GDELPDDIIS		TGNVMTLKFL		SDASVTAGGF		QIKYVAMDPV
SKSSQGKNTS		TTSTGNKNFL		AGRFSHL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм.

Література

• Lee T.H., Wisniewski H.-G., Vilcek J. (1992). A novel secretory tumor necrosis factor-inducible protein (TSG-6) is a member of the family of hyaluronate binding proteins, closely related to the adhesion receptor CD44. J. Cell Biol. 116: 545—557. PMID 1730767 DOI:10.1083/jcb.116.2.545
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wisniewski H.-G., Burgess W.H., Oppenheim J.D., Vilcek J. (1994). TSG-6, an arthritis-associated hyaluronan binding protein, forms a stable complex with the serum protein inter-alpha-inhibitor. Biochemistry. 33: 7423—7429. PMID 7516184 DOI:10.1021/bi00189a049

Див. також

• Хромосома 2