TNN

TNN
Ідентифікатори
Символи	TNN, TN-W, tenascin N, TNW
Зовнішні ІД	OMIM: 617472 MGI: 2665790 HomoloGene: 18634 GeneCards: TNN
Онтологія гена Молекулярна функція • integrin binding • identical protein binding • молекулярна функція Клітинна компонента • extracellular region • cell surface • компонент клітини • neuron projection • neuronal cell body • CA3 pyramidal cell dendrite • hippocampal mossy fiber expansion • GO:0005578 Позаклітинна матриця Біологічний процес • cell-matrix adhesion • аксоноґенеза • osteoblast development • negative regulation of osteoblast proliferation • negative regulation of osteoblast differentiation • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway involved in osteoblast differentiation • dendrite self-avoidance • negative regulation of neuron migration Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	63923	329278
Ensembl	ENSG00000120332	ENSMUSG00000026725
UniProt	Q9UQP3	Q80Z71
RefSeq (мРНК)	NM_022093	NM_177839
RefSeq (білок)	NP_071376	NP_808507
Локус (UCSC)	Хр. 1: 175.07 – 175.15 Mb	Хр. 1: 159.91 – 159.98 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TNN (англ. Tenascin N) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 299 амінокислот, а молекулярна маса — 144 034.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSLQEMFRFP		MGLLLGSVLL		VASAPATLEP		PGCSNKEQQV		TVSHTYKIDV
PKSALVQVDA		DPQPLSDDGA		SLLALGEARE		EQNIIFRHNI		RLQTPQKDCE
LAGSVQDLLA		RVKKLEEEMV		EMKEQCSAQR		CCQGVTDLSR		HCSGHGTFSL
ETCSCHCEEG		REGPACERLA		CPGACSGHGR		CVDGRCLCHE		PYVGADCGYP
ACPENCSGHG		ECVRGVCQCH		EDFMSEDCSE		KRCPGDCSGH		GFCDTGECYC
EEGFTGLDCA		QVVTPQGLQL		LKNTEDSLLV		SWEPSSQVDH		YLLSYYPLGK
ELSGKQIQVP		KEQHSYEILG		LLPGTKYIVT		LRNVKNEVSS		SPQHLLATTD
LAVLGTAWVT		DETENSLDVE		WENPSTEVDY		YKLRYGPMTG		QEVAEVTVPK
SSDPKSRYDI		TGLHPGTEYK		ITVVPMRGEL		EGKPILLNGR		TEIDSPTNVV
TDRVTEDTAT		VSWDPVQAVI		DKYVVRYTSA		DGDTKEMAVH		KDESSTVLTG
LKPGEAYKVY		VWAERGNQGS		KKADTNALTE		IDSPANLVTD		RVTENTATIS
WDPVQATIDK		YVVRYTSADD		QETREVLVGK		EQSSTVLTGL		RPGVEYTVHV
WAQKGDRESK		KADTNAPTDI		DSPKNLVTDR		VTENMATVSW		DPVQAAIDKY
VVRYTSAGGE		TREVPVGKEQ		SSTVLTGLRP		GMEYMVHVWA		QKGDQESKKA
DTKAQTDIDS		PQNLVTDRVT		ENMATVSWDP		VRATIDRYVV		RYTSAKDGET
REVPVGKEQS		STVLTGLRPG		VEYTVHVWAQ		KGAQESKKAD		TKAQTDIDSP
QNLVTDWVTE		NTATVSWDPV		QATIDRYVVH		YTSANGETRE		VPVGKEQSST
VLTGLRPGME		YTVHVWAQKG		NQESKKADTK		AQTEIDGPKN		LVTDWVTENM
ATVSWDPVQA		TIDKYMVRYT		SADGETREVP		VGKEHSSTVL		TGLRPGMEYM
VHVWAQKGAQ		ESKKADTKAQ		TELDPPRNLR		PSAVTQSGGI		LTWTPPSAQI
HGYILTYQFP		DGTVKEMQLG		REDQRFALQG		LEQGATYPVS		LVAFKGGRRS
RNVSTTLSTV		GARFPHPSDC		SQVQQNSNAA		SGLYTIYLHG		DASRPLQVYC
DMETDGGGWI		VFQRRNTGQL		DFFKRWRSYV		EGFGDPMKEF		WLGLDKLHNL
TTGTPARYEV		RVDLQTANES		AYAIYDFFQV		ASSKERYKLT		VGKYRGTAGD
ALTYHNGWKF		TTFDRDNDIA		LSNCALTHHG		GWWYKNCHLA		NPNGRYGETK
HSEGVNWEPW		KGHEFSIPYV		ELKIRPHGYS		REPVLGRKKR		TLRGRLRTF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1