TOP1MT

TOP1MT
Ідентифікатори
Символи	TOP1MT, topoisomerase (DNA) I, mitochondrial, DNA topoisomerase I mitochondrial
Зовнішні ІД	OMIM: 606387 MGI: 1920210 HomoloGene: 43082 GeneCards: TOP1MT
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity • DNA binding • DNA topoisomerase activity • isomerase activity Клітинна компонента • replication fork protection complex • mitochondrial nucleoid • ядерце • мітохондрія • клітинне ядро • хромосома Біологічний процес • реплікація ДНК • ремоделювання хроматину • DNA topological change • chromosome segregation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	116447	72960
Ensembl	ENSG00000184428	ENSMUSG00000000934
UniProt	Q969P6	Q8R4U6
RefSeq (мРНК)	NM_001258446 NM_001258447 NM_052963	NM_028404 NM_001355589
RefSeq (білок)	NP_001245375 NP_001245376 NP_443195	NP_082680 NP_001342518
Локус (UCSC)	Хр. 8: 143.3 – 143.36 Mb	Хр. 15: 75.53 – 75.55 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TOP1MT (англ. DNA topoisomerase I mitochondrial) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 8-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 601 амінокислот, а молекулярна маса — 69 872.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRVVRLLRLR		AALTLLGEVP		RRPASRGVPG		SRRTQKGSGA		RWEKEKHEDG
VKWRQLEHKG		PYFAPPYEPL		PDGVRFFYEG		RPVRLSVAAE		EVATFYGRML
DHEYTTKEVF		RKNFFNDWRK		EMAVEEREVI		KSLDKCDFTE		IHRYFVDKAA
ARKVLSREEK		QKLKEEAEKL		QQEFGYCILD		GHQEKIGNFK		IEPPGLFRGR
GDHPKMGMLK		RRITPEDVVI		NCSRDSKIPE		PPAGHQWKEV		RSDNTVTWLA
AWTESVQNSI		KYIMLNPCSK		LKGETAWQKF		ETARRLRGFV		DEIRSQYRAD
WKSREMKTRQ		RAVALYFIDK		LALRAGNEKE		DGEAADTVGC		CSLRVEHVQL
HPEADGCQHV		VEFDFLGKDC		IRYYNRVPVE		KPVYKNLQLF		MENKDPRDDL
FDRLTTTSLN		KHLQELMDGL		TAKVFRTYNA		SITLQEQLRA		LTRAEDSIAA
KILSYNRANR		VVAILCNHQR		ATPSTFEKSM		QNLQTKIQAK		KEQVAEARAE
LRRARAEHKA		QGDGKSRSVL		EKKRRLLEKL		QEQLAQLSVQ		ATDKEENKQV
ALGTSKLNYL		DPRISIAWCK		RFRVPVEKIY		SKTQRERFAW		ALAMAGEDFE
F

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ізомераз, топоізомераз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 8