TPT1

TPT1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1YZ1, 3EBM, 4Z9V, 2HR9
Ідентифікатори
Символи	TPT1-AS1, HRF, TCTP, p02, p23, tumor protein, translationally-controlled 1, TPT1 antisense RNA 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600763 MGI: 104890 HomoloGene: 55730 GeneCards: TPT1-AS1
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • microtubule binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • multivesicular body • tubulin complex • екзосома • клітинне ядро • міжклітинний простір • гіалоплазма • spindle pole • cytoplasmic microtubule Біологічний процес • regulation of apoptotic process • response to virus • cellular calcium ion homeostasis • negative regulation of apoptotic process • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • calcium ion transport • диференціація клітин Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	100190939	22070
Ensembl	ENSG00000170919	ENSMUSG00000060126
UniProt	P13693	P63028
RefSeq (мРНК)	н/д	NM_009429
RefSeq (білок)	NP_001273201 NP_001273202 NP_003286	NP_033455
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 14: 76.08 – 76.09 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TPT1 (англ. Tumor protein, translationally-controlled 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 172 амінокислот, а молекулярна маса — 19 595.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MIIYRDLISH		DEMFSDIYKI		REIADGLCLE		VEGKMVSRTE		GNIDDSLIGG
NASAEGPEGE		GTESTVITGV		DIVMNHHLQE		TSFTKEAYKK		YIKDYMKSIK
GKLEEQRPER		VKPFMTGAAE		QIKHILANFK		NYQFFIGENM		NPDGMVALLD
YREDGVTPYM		IFFKDGLEME		KC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Gross B., Gaestel M., Boehm H., Bielka H. (1989). cDNA sequence coding for a translationally controlled human tumor protein. Nucleic Acids Res. 17: 8367—8367. PMID 2813067 DOI:10.1093/nar/17.20.8367
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• MacDonald S.M., Rafnar T., Langdon J., Lichtenstein L.M. (1995). Molecular identification of an IgE-dependent histamine-releasing factor. Science. 269: 688—690. PMID 7542803 DOI:10.1126/science.7542803
• Yarm F.R. (2002). Plk phosphorylation regulates the microtubule-stabilizing protein TCTP. Mol. Cell. Biol. 22: 6209—6221. PMID 12167714 DOI:10.1128/MCB.22.17.6209-6221.2002
• Leong W.F., Chow V.T. (2006). Transcriptomic and proteomic analyses of rhabdomyosarcoma cells reveal differential cellular gene expression in response to enterovirus 71 infection. Cell. Microbiol. 8: 565—580. PMID 16548883 DOI:10.1111/j.1462-5822.2005.00644.x

Див. також

• Хромосома 13