TRAF1

TRAF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3M0D
Ідентифікатори
Символи	TRAF1, EBI6, MGC:10353, TNF receptor associated factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601711 HomoloGene: 4138 GeneCards: TRAF1
Онтологія гена Молекулярна функція • thioesterase binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • identical protein binding • tumor necrosis factor receptor binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • regulation of apoptotic process • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0097285 апоптоз • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • GO:0034622 protein-containing complex assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7185	687813
Ensembl	ENSG00000056558	ENSRNOG00000048914
UniProt	Q13077	A0A1B0GWY7
RefSeq (мРНК)	NM_005658 NM_001190945 NM_001190947	NM_001271240
RefSeq (білок)	NP_001177874 NP_001177876 NP_005649	NP_001258169
Локус (UCSC)	Хр. 9: 120.9 – 120.93 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRAF1 (англ. TNF receptor associated factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 416 амінокислот, а молекулярна маса — 46 164.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASSSGSSPR		PAPDENEFPF		GCPPTVCQDP		KEPRALCCAG		CLSENPRNGE
DQICPKCRGE		DLQSISPGSR		LRTQEKAHPE		VAEAGIGCPF		AGVGCSFKGS
PQSVQEHEVT		SQTSHLNLLL		GFMKQWKARL		GCGLESGPMA		LEQNLSDLQL
QAAVEVAGDL		EVDCYRAPCS		ESQEELALQH		FMKEKLLAEL		EGKLRVFENI
VAVLNKEVEA		SHLALATSIH		QSQLDRERIL		SLEQRVVELQ		QTLAQKDQAL
GKLEQSLRLM		EEASFDGTFL		WKITNVTRRC		HESACGRTVS		LFSPAFYTAK
YGYKLCLRLY		LNGDGTGKRT		HLSLFIVIMR		GEYDALLPWP		FRNKVTFMLL
DQNNREHAID		AFRPDLSSAS		FQRPQSETNV		ASGCPLFFPL		SKLQSPKHAY
VKDDTMFLKC		IVETST

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Rothe M., Wong S.C., Henzel W.J., Goeddel D.V. (1994). A novel family of putative signal transducers associated with the cytoplasmic domain of the 75 kDa tumor necrosis factor receptor. Cell. 78: 681—692. PMID 8069916 DOI:10.1016/0092-8674(94)90532-0
• Lee S.Y., Park C.G., Choi Y. (1996). T cell receptor-dependent cell death of T cell hybridomas mediated by the CD30 cytoplasmic domain in association with tumor necrosis factor receptor-associated factors. J. Exp. Med. 183: 669—674. PMID 8627180 DOI:10.1084/jem.183.2.669
• McCarthy J.V., Ni J., Dixit V.M. (1998). RIP2 is a novel NF-kappaB-activating and cell death-inducing kinase. J. Biol. Chem. 273: 16968—16975. PMID 9642260 DOI:10.1074/jbc.273.27.16968
• Arch R.H., Thompson C.B. (1998). 4-1BB and Ox40 are members of a tumor necrosis factor (TNF)-nerve growth factor receptor subfamily that bind TNF receptor-associated factors and activate nuclear factor kappaB. Mol. Cell. Biol. 18: 558—565. PMID 9418902 DOI:10.1128/MCB.18.1.558
• Irmler M., Steiner V., Ruegg C., Wajant H., Tschopp J. (2000). Caspase-induced inactivation of the anti-apoptotic TRAF1 during Fas ligand-mediated apoptosis. FEBS Lett. 468: 129—133. PMID 10692572 DOI:10.1016/S0014-5793(00)01206-0

Див. також

• Хромосома 9