TRAF3IP1

TRAF3IP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EQO
Ідентифікатори
Символи	TRAF3IP1, IFT54, MIP-T3, MIPT3, SLSN9, TRAF3 interacting protein 1, FAP116
Зовнішні ІД	OMIM: 607380 MGI: 1921269 HomoloGene: 22913 GeneCards: TRAF3IP1
Онтологія гена Молекулярна функція • microtubule binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • intraciliary transport particle B • цитоплазма • ciliary basal body • центросома • cell projection • ciliary transition zone • ciliary base • ciliary tip • GO:0035085 Аксонема • цитоскелет • війка Біологічний процес • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation • negative regulation of defense response to virus • розвиток нирки • intraciliary transport • GO:0106160 negative regulation of protein-containing complex assembly • negative regulation of smoothened signaling pathway involved in dorsal/ventral neural tube patterning • regulation of microtubule cytoskeleton organization • embryonic digit morphogenesis • morphogenesis of a polarized epithelium • negative regulation of interferon-beta production • embryonic heart tube development • embryonic camera-type eye development • neural tube patterning • cell projection organization • post-anal tail morphogenesis • negative regulation of type I interferon production • intraciliary transport involved in cilium assembly • cilium assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26146	74019
Ensembl	ENSG00000204104	ENSMUSG00000034292
UniProt	Q8TDR0	Q149C2
RefSeq (мРНК)	NM_001139490 NM_015650	NM_028718
RefSeq (білок)	NP_001132962 NP_056465	NP_082994
Локус (UCSC)	Хр. 2: 238.32 – 238.4 Mb	Хр. 1: 91.42 – 91.46 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRAF3IP1 (англ. TRAF3 interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 691 амінокислот, а молекулярна маса — 78 632.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNAAVVRRTQ		EALGKVIRRP		PLTEKLLSKP		PFRYLHDIIT		EVIRMTGFMK
GLYTDAEMKS		DNVKDKDAKI		SFLQKAIDVV		VMVSGEPLLA		KPARIVAGHE
PERTNELLQI		IGKCCLNKLS		SDDAVRRVLA		GEKGEVKGRA		SLTSRSQELD
NKNVREEESR		VHKNTEDRGD		AEIKERSTSR		DRKQKEELKE		DRKPREKDKD
KEKAKENGGN		RHREGERERA		KARARPDNER		QKDRGNRERD		RDSERKKETE
RKSEGGKEKE		RLRDRDRERD		RDKGKDRDRR		RVKNGEHSWD		LDREKNREHD
KPEKKSASSG		EMSKKLSDGT		FKDSKAETET		EISTRASKSL		TTKTSKRRSK
NSVEGRKEDN		ISAKSLDSIV		SGINNEPNQE		TTTSEIGTKE		ANINSTSISD
DNSASLRCEN		IQPNPTEKQK		GDSTSDAEGD		AGPAGQDKSE		VPETPEIPNE
LSSNIRRIPR		PGSARPAPPR		VKRQDSMEAL		QMDRSGSGKT		VSNVITESHN
SDNEEDDQFV		VEAAPQLSEM		SEIEMVTAVE		LEEEEKHGGL		VKKILETKKD
YEKLQQSPKP		GEKERSLFES		AWKKEKDIVS		KEIEKLRTSI		QTLCKSALPL
GKIMDYIQED		VDAMQNELQM		WHSENRQHAE		ALQQEQRITD		CAVEPLKAEL
AELEQLIKDQ		QDKICAVKAN		ILKNEEKIQK		MVYSINLTSR		R

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біогенез та деградація війок, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних відростках, війках.

Література

• Ling L., Goeddel D.V. (2000). MIP-T3, a novel protein linking tumor necrosis factor receptor-associated factor 3 to the microtubule network. J. Biol. Chem. 275: 23852—23860. PMID 10791955 DOI:10.1074/jbc.M001095200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Morris J.A., Kandpal G., Ma L., Austin C.P. (2003). DISC1 (Disrupted-In-Schizophrenia 1) is a centrosome-associated protein that interacts with MAP1A, MIPT3, ATF4/5 and NUDEL: regulation and loss of interaction with mutation. Hum. Mol. Genet. 12: 1591—1608. PMID 12812986 DOI:10.1093/hmg/ddg162

Див. також

• Хромосома 2