TRAF3IP2

TRAF3IP2
Ідентифікатори
Символи	TRAF3IP2, ACT1, C6orf2, C6orf4, C6orf5, C6orf6, CANDF8, CIKS, PSORS13, TRAF3 interacting protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 607043 MGI: 2143599 HomoloGene: 15885 GeneCards: TRAF3IP2
Реагує на сполуку
iguratimod
Онтологія гена Молекулярна функція • signaling receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • компонент клітини Біологічний процес • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • GO:0007243 intracellular signal transduction • humoral immune response • B cell apoptotic process • positive regulation of defense response to virus by host Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10758	103213
Ensembl	ENSG00000056972	ENSMUSG00000019842
UniProt	O43734	Q8N7N6
RefSeq (мРНК)	NM_001164281 NM_001164282 NM_001164283 NM_147200 NM_147686	NM_134000
RefSeq (білок)	NP_001157753 NP_001157755 NP_671733 NP_679211	NP_598761
Локус (UCSC)	Хр. 6: 111.56 – 111.61 Mb	Хр. 10: 39.49 – 39.53 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRAF3IP2 (англ. TRAF3 interacting protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 574 амінокислот, а молекулярна маса — 64 666.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPPQLQETRM		NRSIPVEVDE		SEPYPSQLLK		PIPEYSPEEE		SEPPAPNIRN
MAPNSLSAPT		MLHNSSGDFS		QAHSTLKLAN		HQRPVSRQVT		CLRTQVLEDS
EDSFCRRHPG		LGKAFPSGCS		AVSEPASESV		VGALPAEHQF		SFMEKRNQWL
VSQLSAASPD		TGHDSDKSDQ		SLPNASADSL		GGSQEMVQRP		QPHRNRAGLD
LPTIDTGYDS		QPQDVLGIRQ		LERPLPLTSV		CYPQDLPRPL		RSREFPQFEP
QRYPACAQML		PPNLSPHAPW		NYHYHCPGSP		DHQVPYGHDY		PRAAYQQVIQ
PALPGQPLPG		ASVRGLHPVQ		KVILNYPSPW		DHEERPAQRD		CSFPGLPRHQ
DQPHHQPPNR		AGAPGESLEC		PAELRPQVPQ		PPSPAAVPRP		PSNPPARGTL
KTSNLPEELR		KVFITYSMDT		AMEVVKFVNF		LLVNGFQTAI		DIFEDRIRGI
DIIKWMERYL		RDKTVMIIVA		ISPKYKQDVE		GAESQLDEDE		HGLHTKYIHR
MMQIEFIKQG		SMNFRFIPVL		FPNAKKEHVP		TWLQNTHVYS		WPKNKKNILL
RLLREEEYVA		PPRGPLPTLQ		VVPL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• Morelli C., Magnanini C., Mungall A.J., Negrini M., Barbanti-Brodano G. (2000). Cloning and characterization of two overlapping genes in a subregion at 6q21 involved in replicative senescence and schizophrenia. Gene. 252: 217—225. PMID 10903453 DOI:10.1016/S0378-1119(00)00231-6
• Leonardi A., Chariot A., Claudio E., Cunningham K., Siebenlist U. (2000). CIKS, a connection to Ikappa B kinase and stress-activated protein kinase. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 10494—10499. PMID 10962033 DOI:10.1073/pnas.190245697
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kanamori M., Kai C., Hayashizaki Y., Suzuki H. (2002). NF-kappaB activator Act1 associates with IL-1/Toll pathway adaptor molecule TRAF6. FEBS Lett. 532: 241—246. PMID 12459498 DOI:10.1016/S0014-5793(02)03688-8

Див. також

• Хромосома 6