TRAF5

TRAF5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4GJH
Ідентифікатори
Символи	TRAF5, MGC:39780, RNF84, TNF receptor associated factor 5
Зовнішні ІД	OMIM: 602356 MGI: 107548 HomoloGene: 27079 GeneCards: TRAF5
Онтологія гена Молекулярна функція • thioesterase binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • зв'язування з іоном металу • identical protein binding • tumor necrosis factor receptor binding Клітинна компонента • гіалоплазма • cytoplasmic side of plasma membrane • центросома • CD40 receptor complex • цитоплазма • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • regulation of apoptotic process • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0097285 апоптоз Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7188	22033
Ensembl	ENSG00000082512	ENSMUSG00000026637
UniProt	O00463	P70191
RefSeq (мРНК)	NM_001033910 NM_004619 NM_145759 NM_001319207	NM_011633
RefSeq (білок)	NP_001029082 NP_001306136 NP_004610 NP_665702	NP_035763
Локус (UCSC)	Хр. 1: 211.33 – 211.37 Mb	Хр. 1: 191.73 – 191.78 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRAF5 (англ. TNF receptor associated factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 557 амінокислот, а молекулярна маса — 64 406.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAYSEEHKGM		PCGFIRQNSG		NSISLDFEPS		IEYQFVERLE		ERYKCAFCHS
VLHNPHQTGC		GHRFCQHCIL		SLRELNTVPI		CPVDKEVIKS		QEVFKDNCCK
REVLNLYVYC		SNAPGCNAKV		ILGRYQDHLQ		QCLFQPVQCS		NEKCREPVLR
KDLKEHLSAS		CQFRKEKCLY		CKKDVVVINL		QNHEENLCPE		YPVFCPNNCA
KIILKTEVDE		HLAVCPEAEQ		DCPFKHYGCA		VTDKRRNLQQ		HEHSALREHM
RLVLEKNVQL		EEQISDLHKS		LEQKESKIQQ		LAETIKKLEK		EFKQFAQLFG
KNGSFLPNIQ		VFASHIDKSA		WLEAQVHQLL		QMVNQQQNKF		DLRPLMEAVD
TVKQKITLLE		NNDQRLAVLE		EETNKHDTHI		NIHKAQLSKN		EERFKLLEGT
CYNGKLIWKV		TDYKMKKREA		VDGHTVSIFS		QSFYTSRCGY		RLCARAYLNG
DGSGRGSHLS		LYFVVMRGEF		DSLLQWPFRQ		RVTLMLLDQS		GKKNIMETFK
PDPNSSSFKR		PDGEMNIASG		CPRFVAHSVL		ENAKNAYIKD		DTLFLKVAVD
LTDLEDL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wajant H., Henkler F., Scheurich P. (2001). The TNF-receptor-associated factor family: scaffold molecules for cytokine receptors, kinases and their regulators. Cell. Signal. 13: 389—400. PMID 11384837 DOI:10.1016/S0898-6568(01)00160-7
• Bradley J.R., Pober J.S. (2001). Tumor necrosis factor receptor-associated factors (TRAFs). Oncogene. 20: 6482—6491. PMID 11607847 DOI:10.1038/sj.onc.1204788
• Song H.Y., Regnier C.H., Kirschning C.J., Goeddel D.V., Rothe M. (1997). Tumor necrosis factor (TNF)-mediated kinase cascades: bifurcation of nuclear factor-kappaB and c-jun N-terminal kinase (JNK/SAPK) pathways at TNF receptor-associated factor 2. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 9792—9796. PMID 9275204 DOI:10.1073/pnas.94.18.9792
• Kawamata S., Hori T., Imura A., Takaori-Kondo A., Uchiyama T. (1998). Activation of OX40 signal transduction pathways leads to tumor necrosis factor receptor-associated factor (TRAF) 2- and TRAF5-mediated NF-kappaB activation. J. Biol. Chem. 273: 5808—5814. PMID 9488716 DOI:10.1074/jbc.273.10.5808
• McCarthy J.V., Ni J., Dixit V.M. (1998). RIP2 is a novel NF-kappaB-activating and cell death-inducing kinase. J. Biol. Chem. 273: 16968—16975. PMID 9642260 DOI:10.1074/jbc.273.27.16968

Див. також

• Хромосома 1