TRAFD1

TRAFD1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2D9K
Ідентифікатори
Символи	TRAFD1, FLN29, TRAF-type zinc finger domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 613197 MGI: 1923551 HomoloGene: 31399 GeneCards: TRAFD1
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10906	231712
Ensembl	ENSG00000135148	ENSMUSG00000042726
UniProt	O14545	Q3UDK1
RefSeq (мРНК)	NM_006700 NM_001143906	NM_001163470 NM_172275 NM_001359947
RefSeq (білок)	NP_001137378 NP_006691	NP_001156942 NP_758479 NP_001346876
Локус (UCSC)	Хр. 12: 112.13 – 112.15 Mb	Хр. 5: 121.51 – 121.52 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRAFD1 (англ. TRAF-type zinc finger domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 582 амінокислот, а молекулярна маса — 64 841.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEFLDDQET		RLCDNCKKEI		PVFNFTIHEI		HCQRNIGMCP		TCKEPFPKSD
METHMAAEHC		QVTCKCNKKL		EKRLLKKHEE		TECPLRLAVC		QHCDLELSIL
KLKEHEDYCG		ARTELCGNCG		RNVLVKDLKT		HPEVCGREGE		EKRNEVAIPP
NAYDESWGQD		GIWIASQLLR		QIEALDPPMR		LPRRPLRAFE		SDVFHNRTTN
QRNITAQVSI		QNNLFEEQER		QERNRGQQPP		KEGGEESANL		DFMLALSLQN
EGQASSVAEQ		DFWRAVCEAD		QSHGGPRSLS		DIKGAADEIM		LPCEFCEELY
PEELLIDHQT		SCNPSRALPS		LNTGSSSPRG		VEEPDVIFQN		FLQQAASNQL
DSLMGLSNSH		PVEESIIIPC		EFCGVQLEEE		VLFHHQDQCD		QRPATATNHV
TEGIPRLDSQ		PQETSPELPR		RRVRHQGDLS		SGYLDDTKQE		TANGPTSCLP
PSRPINNMTA		TYNQLSRSTS		GPRPGCQPSS		PCVPKLSNSD		SQDIQGRNRD
SQNGAIAPGH		VSVIRPPQNL		YPENIVPSFS		PGPSGRYGAS		GRSEGGRNSR
VTPAAANYRS		RTAKAKPSKQ		QGAGDAEEEE		EE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 12