TRAPPC4

TRAPPC4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2J3T, 2JSN, 2ZMV
Ідентифікатори
Символи	TRAPPC4, HSPC172, PTD009, SBDN, SYNBINDIN, TRS23, CGI-104, trafficking protein particle complex 4, NEDESBA, trafficking protein particle complex subunit 4
Зовнішні ІД	OMIM: 610971 MGI: 1926211 HomoloGene: 105453 GeneCards: TRAPPC4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • Синаптичні бульбашки • синапс • дендрит (нейробіологія) • ендоплазматичний ретикулум • Golgi stack • Golgi membrane • TRAPP complex Біологічний процес • dendrite development • COPII vesicle coating • vesicle-mediated transport • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51399	60409
Ensembl	ENSG00000280495 ENSG00000196655	ENSMUSG00000032112
UniProt	Q9Y296	Q9ES56
RefSeq (мРНК)	NM_016146 NM_001318486 NM_001318488 NM_001318489 NM_001318490 NM_001318492 NM_001318494	NM_021789
RefSeq (білок)	NP_001305415 NP_001305417 NP_001305418 NP_001305419 NP_001305421 NP_001305423 NP_057230	NP_068561
Локус (UCSC)	Хр. 11: 119.02 – 119.03 Mb	Хр. 9: 44.31 – 44.32 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRAPPC4 (англ. Trafficking protein particle complex 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 219 амінокислот, а молекулярна маса — 24 340.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAIFSVYVVN		KAGGLIYQLD		SYAPRAEAEK		TFSYPLDLLL		KLHDERVLVA
FGQRDGIRVG		HAVLAINGMD		VNGRYTADGK		EVLEYLGNPA		NYPVSIRFGR
PRLTSNEKLM		LASMFHSLFA		IGSQLSPEQG		SSGIEMLETD		TFKLHCYQTL
TGIKFVVLAD		PRQAGIDSLL		RKIYEIYSDF		ALKNPFYSLE		MPIRCELFDQ
NLKLALEVAE		KAGTFGPGS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.

Література

• Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11