TRAPPC8

TRAPPC8
Ідентифікатори
Символи	TRAPPC8, GSG1, HsT2706, KIAA1012, TRS85, trafficking protein particle complex 8, trafficking protein particle complex subunit 8
Зовнішні ІД	OMIM: 614136 MGI: 2443008 HomoloGene: 40993 GeneCards: TRAPPC8
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • phagophore assembly site • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • TRAPPIII protein complex • комплекс Ґольджі • гіалоплазма • TRAPP complex Біологічний процес • protein localization to phagophore assembly site • autophagy of peroxisome • cytoplasm to vacuole transport by the Cvt pathway • autophagy of nucleus • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • vesicle-mediated transport • Golgi organization • autophagosome assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22878	75964
Ensembl	ENSG00000153339	ENSMUSG00000033382
UniProt	Q9Y2L5	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_014939	NM_029491 NM_177038 NM_001361188 NM_001379370
RefSeq (білок)	NP_055754	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 18: 31.83 – 31.95 Mb	Хр. 18: 20.95 – 21.03 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRAPPC8 (англ. Trafficking protein particle complex 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 435 амінокислот, а молекулярна маса — 160 997.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAQCVQSVQE		LIPDSFVPCV		AALCSDEAER		LTRLNHLSFA		ELLKPFSRLT
SEVHMRDPNN		QLHVIKNLKI		AVSNIVTQPP		QPGAIRKLLN		DVVSGSQPAE
GLVANVITAG		DYDLNISATT		PWFESYRETF		LQSMPALDHE		FLNHYLACML
VASSSEAEPV		EQFSKLSQEQ		HRIQHNSDYS		YPKWFIPNTL		KYYVLLHDVS
AGDEQRAESI		YEEMKQKYGT		QGCYLLKINS		RTSNRASDEQ		IPDPWSQYLQ
KNSIQNQESY		EDGPCTITSN		KNSDNNLLSL		DGLDNEVKDG		LPNNFRAHPL
QLEQSSDPSN		SIDGPDHLRS		ASSLHETKKG		NTGIIHGACL		TLTDHDRIRQ
FIQEFTFRGL		LPHIEKTIRQ		LNDQLISRKG		LSRSLFSATK		KWFSGSKVPE
KSINDLKNTS		GLLYPPEAPE		LQIRKMADLC		FLVQHYDLAY		SCYHTAKKDF
LNDQAMLYAA		GALEMAAVSA		FLQPGAPRPY		PAHYMDTAIQ		TYRDICKNMV
LAERCVLLSA		ELLKSQSKYS		EAAALLIRLT		SEDSDLRSAL		LLEQAAHCFI
NMKSPMVRKY		AFHMILAGHR		FSKAGQKKHA		LRCYCQAMQV		YKGKGWSLAE
DHINFTIGRQ		SYTLRQLDNA		VSAFRHILIN		ESKQSAAQQG		AFLREYLYVY
KNVSQLSPDG		PLPQLPLPYI		NSSATRVFFG		HDRRPADGEK		QAATHVSLDQ
EYDSESSQQW		RELEEQVVSV		VNKGVIPSNF		HPTQYCLNSY		SDNSRFPLAV
VEEPITVEVA		FRNPLKVLLL		LTDLSLLWKF		HPKDFSGKDN		EEVKQLVTSE
PEMIGAEVIS		EFLINGEESK		VARLKLFPHH		IGELHILGVV		YNLGTIQGSM
TVDGIGALPG		CHTGKYSLSM		SVRGKQDLEI		QGPRLNNTKE		EKTSVKYGPD
RRLDPIITEE		MPLLEVFFIH		FPTGLLCGEI		RKAYVEFVNV		SKCPLTGLKV
VSKRPEFFTF		GGNTAVLTPL		SPSASENCSA		YKTVVTDATS		VCTALISSAS
SVDFGIGTGS		QPEVIPVPLP		DTVLLPGASV		QLPMWLRGPD		EEGVHEINFL
FYYESVKKQP		KIRHRILRHT		AIICTSRSLN		VRATVCRSNS		LENEEGRGGN
MLVFVDVENT		NTSEAGVKEF		HIVQVSSSSK		HWKLQKSVNL		SENKDTKLAS
REKGKFCFKA		IRCEKEEAAT		QSSEKYTFAD		IIFGNEQIIS		SASPCADFFY
RSLSSELKKP		QAHLPVHTEK		QSTEDAVRLI		QKCSEVDLNI		VILWKAYVVE
DSKQLILEGQ		HHVILRTIGK		EAFSYPQKQE		PPEMELLKFF		RPENITVSSR
PSVEQLSSLI		KTSLHYPESF		NHPFHQKSLC		LVPVTLLLSN		CSKADVDVIV
DLRHKTTSPE		ALEIHGSFTW		LGQTQYKLQL		KSQEIHSLQL		KACFVHTGVY
NLGTPRVFAK		LSDQVTVFET		SQQNSMPALI		IISNV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, альтернативний сплайсинг. Локалізований у апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 18