TREM1

TREM1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1Q8M, 1SMO
Ідентифікатори
Символи	TREM1, CD354, TREM-1, triggering receptor expressed on myeloid cells 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605085 MGI: 1930005 HomoloGene: 10243 GeneCards: TREM1
Онтологія гена Молекулярна функція • scaffold protein binding • signaling receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • extracellular region • внутрішньоклітинний Біологічний процес • GO:0007243 intracellular signal transduction • humoral immune response • regulation of immune response • вроджений імунітет • leukocyte migration • acute inflammatory response Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54210	58217
Ensembl	ENSG00000124731	ENSMUSG00000042265
UniProt	Q9NP99	Q9JKE2
RefSeq (мРНК)	NM_001242589 NM_001242590 NM_018643	NM_021406 NM_001347399
RefSeq (білок)	NP_001229518 NP_001229519 NP_061113	NP_001334328 NP_067381
Локус (UCSC)	Хр. 6: 41.27 – 41.29 Mb	Хр. 17: 48.54 – 48.55 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TREM1 (англ. Triggering receptor expressed on myeloid cells 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 234 амінокислот, а молекулярна маса — 26 387.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRKTRLWGLL		WMLFVSELRA		ATKLTEEKYE		LKEGQTLDVK		CDYTLEKFAS
SQKAWQIIRD		GEMPKTLACT		ERPSKNSHPV		QVGRIILEDY		HDHGLLRVRM
VNLQVEDSGL		YQCVIYQPPK		EPHMLFDRIR		LVVTKGFSGT		PGSNENSTQN
VYKIPPTTTK		ALCPLYTSPR		TVTQAPPKST		ADVSTPDSEI		NLTNVTDIIR
VPVFNIVILL		AGGFLSKSLV		FSVLFAVTLR		SFVP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Bouchon A., Dietrich J., Colonna M. (2000). Inflammatory responses can be triggered by TREM-1, a novel receptor expressed on neutrophils and monocytes. J. Immunol. 164: 4991—4995. PMID 10799849 DOI:10.4049/jimmunol.164.10.4991
• Gingras M.-C., Lapillonne H., Margolin J.F. (2002). TREM-1, MDL-1, and DAP12 expression is associated with a mature stage of myeloid development. Mol. Immunol. 38: 817—824. PMID 11922939 DOI:10.1016/S0161-5890(02)00004-4
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bouchon A., Facchetti F., Weigand M.A., Colonna M. (2001). TREM-1 amplifies inflammation and is a crucial mediator of septic shock. Nature. 410: 1103—1107. PMID 11323674 DOI:10.1038/35074114
• Radaev S., Kattah M., Rostro B., Colonna M., Sun P.D. (2003). Crystal structure of the human myeloid cell activating receptor TREM-1. Structure. 11: 1527—1535. PMID 14656437 DOI:10.1016/j.str.2003.11.001

Див. також

• Хромосома 6