TREML1

TREML1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2FRG
Ідентифікатори
Символи	TREML1, GLTL1825, PRO3438, TLT-1, TLT1, dJ238O23.3, triggering receptor expressed on myeloid cells like 1
Зовнішні ІД	OMIM: 609714 MGI: 1918576 HomoloGene: 52257 GeneCards: TREML1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • cell surface • platelet alpha granule Біологічний процес • вроджений імунітет • calcium-mediated signaling • regulation of immune response • platelet activation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	340205	71326
Ensembl	ENSG00000161911	ENSMUSG00000023993
UniProt	Q86YW5	Q8K558
RefSeq (мРНК)	NM_178174 NM_001271807 NM_001271808	NM_001289451 NM_001289457 NM_027763
RefSeq (білок)	NP_001258736 NP_001258737 NP_835468	NP_001276380 NP_001276386 NP_082039
Локус (UCSC)	Хр. 6: 41.15 – 41.15 Mb	Хр. 17: 48.67 – 48.67 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TREML1 (англ. Triggering receptor expressed on myeloid cells like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 311 амінокислот, а молекулярна маса — 32 679.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGLTLLLLLL		LGLEGQGIVG		SLPEVLQAPV		GSSILVQCHY		RLQDVKAQKV
WCRFLPEGCQ		PLVSSAVDRR		APAGRRTFLT		DLGGGLLQVE		MVTLQEEDAG
EYGCMVDGAR		GPQILHRVSL		NILPPEEEEE		THKIGSLAEN		AFSDPAGSAN
PLEPSQDEKS		IPLIWGAVLL		VGLLVAAVVL		FAVMAKRKQG		NRLGVCGRFL
SSRVSGMNPS		SVVHHVSDSG		PAAELPLDVP		HIRLDSPPSF		DNTTYTSLPL
DSPSGKPSLP		APSSLPPLPP		KVLVCSKPVT		YATVIFPGGN		KGGGTSCGPA
QNPPNNQTPS		S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

• Washington A.V., Quigley L., McVicar D.W. (2002). Initial characterization of TREM-like transcript (TLT)-1: a putative inhibitory receptor within the TREM cluster. Blood. 100: 3822—3824. PMID 12393607 DOI:10.1182/blood-2002-02-0523
• Allcock R.J.N., Barrow A.D., Forbes S., Beck S., Trowsdale J. (2003). The human TREM gene cluster at 6p21.1 encodes both activating and inhibitory single IgV domain receptors and includes NKp44. Eur. J. Immunol. 33: 567—577. PMID 12645956 DOI:10.1002/immu.200310033
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Dowal L., Yang W., Freeman M.R., Steen H., Flaumenhaft R. (2011). Proteomic analysis of palmitoylated platelet proteins. Blood. 118: E62—E73. PMID 21813449 DOI:10.1182/blood-2011-05-353078

Див. також

• Хромосома 6