TRIM29

TRIM29
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CSV
Ідентифікатори
Символи	TRIM29, ATDC, tripartite motif containing 29
Зовнішні ІД	OMIM: 610658 MGI: 1919419 HomoloGene: 8100 GeneCards: TRIM29
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • p53 binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • cadherin binding involved in cell-cell adhesion • identical protein binding Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • цитоплазма • лізосома Біологічний процес • negative regulation of protein localization to nucleus • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • cell-cell adhesion • процес імунної системи • вроджений імунітет Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23650	72169
Ensembl	ENSG00000137699	ENSMUSG00000032013
UniProt	Q14134	Q8R2Q0
RefSeq (мРНК)	NM_012101 NM_058193 NM_001330382	NM_023655
RefSeq (білок)	NP_001317311 NP_036233	NP_076144
Локус (UCSC)	Хр. 11: 120.11 – 120.19 Mb	Хр. 9: 43.22 – 43.25 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRIM29 (англ. Tripartite motif containing 29) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 588 амінокислот, а молекулярна маса — 65 835.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEAADASRSN		GSSPEARDAR		SPSGPSGSLE		NGTKADGKDA		KTTNGHGGEA
AEGKSLGSAL		KPGEGRSALF		AGNEWRRPII		QFVESGDDKN		SNYFSMDSME
GKRSPYAGLQ		LGAAKKPPVT		FAEKGELRKS		IFSESRKPTV		SIMEPGETRR
NSYPRADTGL		FSRSKSGSEE		VLCDSCIGNK		QKAVKSCLVC		QASFCELHLK
PHLEGAAFRD		HQLLEPIRDF		EARKCPVHGK		TMELFCQTDQ		TCICYLCMFQ
EHKNHSTVTV		EEAKAEKETE		LSLQKEQLQL		KIIEIEDEAE		KWQKEKDRIK
SFTTNEKAIL		EQNFRDLVRD		LEKQKEEVRA		ALEQREQDAV		DQVKVIMDAL
DERAKVLHED		KQTREQLHSI		SDSVLFLQEF		GALMSNYSLP		PPLPTYHVLL
EGEGLGQSLG		NFKDDLLNVC		MRHVEKMCKA		DLSRNFIERN		HMENGGDHRY
VNNYTNSFGG		EWSAPDTMKR		YSMYLTPKGG		VRTSYQPSSP		GRFTKETTQK
NFNNLYGTKG		NYTSRVWEYS		SSIQNSDNDL		PVVQGSSSFS		LKGYPSLMRS
QSPKAQPQTW		KSGKQTMLSH		YRPFYVNKGN		GIGSNEAP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Leonhardt E.A., Kapp L.N., Young B.R., Murnane J.P. (1994). Nucleotide sequence analysis of a candidate gene for ataxia-telangiectasia group D (ATDC). Genomics. 19: 130—136. PMID 8188213 DOI:10.1006/geno.1994.1022
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Laderoute K.R., Knapp A.M., Green C.J., Sutherland R.M., Kapp L.N. (1996). Expression of the ATDC (ataxia telangiectasia group D-complementing) gene in A431 human squamous carcinoma cells. Int. J. Cancer. 66: 772—778. PMID 8647648 DOI:10.1002/(SICI)1097-0215(19960611)66:6<772::AID-IJC11>3.0.CO;2-5
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 11