TRIM3

TRIM3
Ідентифікатори
Символи	TRIM3, BERP, HAC1, RNF22, RNF97, tripartite motif containing 3
Зовнішні ІД	OMIM: 605493 MGI: 1860040 HomoloGene: 21290 GeneCards: TRIM3
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • ендосома • early endosome • внутрішньоклітинний • комплекс Ґольджі • дендрит (нейробіологія) • cell projection Біологічний процес • protein transport • Убіквітин-залежний протеоліз • нейробіологія розвитку • protein polyubiquitination • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10612	55992
Ensembl	ENSG00000110171	ENSMUSG00000036989
UniProt	O75382	Q9R1R2
RefSeq (мРНК)	NM_001248006 NM_001248007 NM_006458 NM_033278 NM_033279	NM_001285870 NM_001285871 NM_001285873 NM_018880 NM_001360425
RefSeq (білок)	NP_001234935 NP_001234936 NP_006449 NP_150594	NP_001272799 NP_001272800 NP_001272802 NP_061368 NP_001347354
Локус (UCSC)	Хр. 11: 6.45 – 6.47 Mb	Хр. 7: 105.25 – 105.28 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRIM3 (англ. Tripartite motif containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 744 амінокислот, а молекулярна маса — 80 830.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAKREDSPGP		EVQPMDKQFL		VCSICLDRYQ		CPKVLPCLHT		FCERCLQNYI
PAQSLTLSCP		VCRQTSILPE		QGVSALQNNF		FISSLMEAMQ		QAPDGAHDPE
DPHPLSVVAG		RPLSCPNHEG		KTMEFYCEAC		ETAMCGECRA		GEHREHGTVL
LRDVVEQHKA		ALQRQLEAVR		GRLPQLSAAI		ALVGGISQQL		QERKAEALAQ
ISAAFEDLEQ		ALQQRKQALV		SDLETICGAK		QKVLQSQLDT		LRQGQEHIGS
SCSFAEQALR		LGSAPEVLLV		RKHMRERLAA		LAAQAFPERP		HENAQLELVL
EVDGLRRSVL		NLGALLTTSA		TAHETVATGE		GLRQALVGQP		ASLTVTTKDK
DGRLVRTGSA		ELRAEITGPD		GTRLPVPVVD		HKNGTYELVY		TARTEGELLL
SVLLYGQPVR		GSPFRVRALR		PGDLPPSPDD		VKRRVKSPGG		PGSHVRQKAV
RRPSSMYSTG		GKRKDNPIED		ELVFRVGSRG		REKGEFTNLQ		GVSAASSGRI
VVADSNNQCI		QVFSNEGQFK		FRFGVRGRSP		GQLQRPTGVA		VDTNGDIIVA
DYDNRWVSIF		SPEGKFKTKI		GAGRLMGPKG		VAVDRNGHII		VVDNKSCCVF
TFQPNGKLVG		RFGGRGATDR		HFAGPHFVAV		NNKNEIVVTD		FHNHSVKVYS
ADGEFLFKFG		SHGEGNGQFN		APTGVAVDSN		GNIIVADWGN		SRIQVFDSSG
SFLSYINTSA		EPLYGPQGLA		LTSDGHVVVA		DAGNHCFKAY		RYLQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, клітинних відростках, апараті гольджі, ендосомах.

Література

• El-Husseini A.E.-D., Fretier P., Vincent S.R. (2001). Cloning and characterization of a gene (RNF22) encoding a novel brain expressed ring finger protein (BERP) that maps to human chromosome 11p15.5. Genomics. 71: 363—367. PMID 11170753 DOI:10.1006/geno.2000.6452
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11