TRIM31

TRIM31
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2YSJ, 2YSL
Ідентифікатори
Символи	TRIM31, C6orf13, HCG1, HCGI, RNF, tripartite motif containing 31
Зовнішні ІД	OMIM: 609316 MGI: 2385051 HomoloGene: 17137 GeneCards: TRIM31
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • transferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • внутрішньоклітинний • мітохондрія Біологічний процес • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • Убіквітин-залежний протеоліз • interferon-gamma-mediated signaling pathway • negative regulation of viral transcription • вроджений імунітет • negative regulation of viral entry into host cell Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11074	224762
Ensembl	ENSG00000223531 ENSG00000137397 ENSG00000233573 ENSG00000224168 ENSG00000225130 ENSG00000226402 ENSG00000224542 ENSG00000204616	ENSMUSG00000058063
UniProt	Q9BZY9 Q2L6J1	Q8R0K2
RefSeq (мРНК)	NM_007028	NM_146077
RefSeq (білок)	NP_008959 NP_008959.3	NP_666189
Локус (UCSC)	Хр. 6: 30.1 – 30.11 Mb	Хр. 17: 37.21 – 37.22 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRIM31 (англ. Tripartite motif containing 31) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 425 амінокислот, а молекулярна маса — 48 244.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASGQFVNKL		QEEVICPICL		DILQKPVTID		CGHNFCLKCI		TQIGETSCGF
FKCPLCKTSV		RKNAIRFNSL		LRNLVEKIQA		LQASEVQSKR		KEATCPRHQE
MFHYFCEDDG		KFLCFVCRES		KDHKSHNVSL		IEEAAQNYQG		QIQEQIQVLQ
QKEKETVQVK		AQGVHRVDVF		TDQVEHEKQR		ILTEFELLHQ		VLEEEKNFLL
SRIYWLGHEG		TEAGKHYVAS		TEPQLNDLKK		LVDSLKTKQN		MPPRQLLEDI
KVVLCRSEEF		QFLNPTPVPL		ELEKKLSEAK		SRHDSITGSL		KKFKDQLQAD
RKKDENRFFK		SMNKNDMKSW		GLLQKNNHKM		NKTSEPGSSS		AGGRTTSGPP
NHHSSAPSHS		LFRASSAGKV		TFPVCLLASY		DEISGQGASS		QDTKTFDVAL
SEELHAALSE		WLTAIRAWFC		EVPSS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
• Sugiura T., Miyamoto K. (2008). Characterization of TRIM31, upregulated in gastric adenocarcinoma, as a novel RBCC protein. J. Cell. Biochem. 105: 1081—1091. PMID 18773414 DOI:10.1002/jcb.21908

Див. також

• Хромосома 6