TRIM34

TRIM34
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EGP
Ідентифікатори
Символи	TRIM34, IFP1, RNF21, tripartite motif containing 34
Зовнішні ІД	OMIM: 605684 HomoloGene: 136478 GeneCards: TRIM34
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • молекулярна функція Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • внутрішньоклітинний Біологічний процес • protein trimerization • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • defense response to virus • interferon-gamma-mediated signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	53840	н/д
Ensembl	ENSG00000258659	н/д
UniProt	Q9BYJ4	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_130390 NM_001003827 NM_021616 NM_130389	н/д
RefSeq (білок)	NP_001003827 NP_067629 NP_569074	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 11: 5.62 – 5.64 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

TRIM34 (англ. Tripartite motif containing 34) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 488 амінокислот, а молекулярна маса — 56 864.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASKILLNVQ		EEVTCPICLE		LLTEPLSLDC		GHSLCRACIT		VSNKEAVTSM
GGKSSCPVCG		ISYSFEHLQA		NQHLANIVER		LKEVKLSPDN		GKKRDLCDHH
GEKLLLFCKE		DRKVICWLCE		RSQEHRGHHT		VLTEEVFKEC		QEKLQAVLKR
LKKEEEEAEK		LEADIREEKT		SWKYQVQTER		QRIQTEFDQL		RSILNNEEQR
ELQRLEEEEK		KTLDKFAEAE		DELVQQKQLV		RELISDVECR		SQWSTMELLQ
DMSGIMKWSE		IWRLKKPKMV		SKKLKTVFHA		PDLSRMLQMF		RELTAVRCYW
VDVTLNSVNL		NLNLVLSEDQ		RQVISVPIWP		FQCYNYGVLG		SQYFSSGKHY
WEVDVSKKTA		WILGVYCRTY		SRHMKYVVRR		CANRQNLYTK		YRPLFGYWVI
GLQNKCKYGV		FEESLSSDPE		VLTLSMAVPP		CRVGVFLDYE		AGIVSFFNVT
SHGSLIYKFS		KCCFSQPVYP		YFNPWNCPAP		MTLCPPSS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Li X., Yeung D.F., Fiegen A.M., Sodroski J. (2011). Determinants of the higher order association of the restriction factor TRIM5alpha and other tripartite motif (TRIM) proteins. J. Biol. Chem. 286: 27959—27970. PMID 21680743 DOI:10.1074/jbc.M111.260406

Див. також

• Хромосома 11