TRIM39

TRIM39
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DID, 2DIF, 2ECJ
Ідентифікатори
Символи	TRIM39, RNF23, TFP, TRIM39B, tripartite motif containing 39
Зовнішні ІД	OMIM: 605700 MGI: 1890659 HomoloGene: 10940 GeneCards: TRIM39
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • identical protein binding • transferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • внутрішньоклітинний • мітохондрія Біологічний процес • negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process • positive regulation of apoptotic signaling pathway • Убіквітин-залежний протеоліз • GO:0097285 апоптоз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56658	79263
Ensembl	ENSG00000229929 ENSG00000206495 ENSG00000204599 ENSG00000226437 ENSG00000224994 ENSG00000230308 ENSG00000232839	ENSMUSG00000045409
UniProt	Q9HCM9	Q9ESN2
RefSeq (мРНК)	NM_172016 NM_021253 NM_001369521 NM_001369522 NM_001369523	NM_024468 NM_178281 NM_001357889 NM_001374606
RefSeq (білок)	NP_067076 NP_742013 NP_001356450 NP_001356451 NP_001356452	NP_077788 NP_840065 NP_001344818 NP_001361535
Локус (UCSC)	Хр. 6: 30.33 – 30.34 Mb	Хр. 17: 36.57 – 36.58 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRIM39 (англ. Tripartite motif containing 39) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 518 амінокислот, а молекулярна маса — 59 690.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAETSLLEAG		ASAASTAAAL		ENLQVEASCS		VCLEYLKEPV		IIECGHNFCK
ACITRWWEDL		ERDFPCPVCR		KTSRYRSLRP		NRQLGSMVEI		AKQLQAVKRK
IRDESLCPQH		HEALSLFCYE		DQEAVCLICA		ISHTHRAHTV		VPLDDATQEY
KEKLQKCLEP		LEQKLQEITR		CKSSEEKKPG		ELKRLVESRR		QQILREFEEL
HRRLDEEQQV		LLSRLEEEEQ		DILQRLRENA		AHLGDKRRDL		AHLAAEVEGK
CLQSGFEMLK		DVKSTLEKNI		PRKFGGSLST		ICPRDHKALL		GLVKEINRCE
KVKTMEVTSV		SIELEKNFSN		FPRQYFALRK		ILKQLIADVT		LDPETAHPNL
VLSEDRKSVK		FVETRLRDLP		DTPRRFTFYP		CVLATEGFTS		GRHYWEVEVG
DKTHWAVGVC		RDSVSRKGEL		TPLPETGYWR		VRLWNGDKYA		ATTTPFTPLH
IKVKPKRVGI		FLDYEAGTLS		FYNVTDRSHI		YTFTDTFTEK		LWPLFYPGIR
AGRKNAAPLT		IRPPTDWE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6