TRIT1

TRIT1
Ідентифікатори
Символи	TRIT1, IPT, MOD5, GRO1, IPPT, IPTase, hGRO1, tRNA isopentenyltransferase 1, COXPD35
Зовнішні ІД	OMIM: 617840 MGI: 1914216 HomoloGene: 7010 GeneCards: TRIT1
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • ATP binding • зв'язування з іоном металу • tRNA dimethylallyltransferase activity • nucleic acid binding • zinc ion binding Клітинна компонента • цитоплазма • мітохондріальний матрикс • мітохондрія • компонент клітини Біологічний процес • mitochondrial tRNA modification • tRNA processing • tRNA modification Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54802	66966
Ensembl	ENSG00000043514	ENSMUSG00000028653
UniProt	Q9H3H1	Q80UN9
RefSeq (мРНК)	NM_001312691 NM_001312692 NM_017646	NM_025873
RefSeq (білок)	NP_001299620 NP_001299621 NP_060116	NP_080149
Локус (UCSC)	Хр. 1: 39.84 – 39.88 Mb	Хр. 4: 122.91 – 122.95 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRIT1 (англ. TRNA isopentenyltransferase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 467 амінокислот, а молекулярна маса — 52 725.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASVAAARAV		PVGSGLRGLQ		RTLPLVVILG		ATGTGKSTLA		LQLGQRLGGE
IVSADSMQVY		EGLDIITNKV		SAQEQRICRH		HMISFVDPLV		TNYTVVDFRN
RATALIEDIF		ARDKIPIVVG		GTNYYIESLL		WKVLVNTKPQ		EMGTEKVIDR
KVELEKEDGL		VLHKRLSQVD		PEMAAKLHPH		DKRKVARSLQ		VFEETGISHS
EFLHRQHTEE		GGGPLGGPLK		FSNPCILWLH		ADQAVLDERL		DKRVDDMLAA
GLLEELRDFH		RRYNQKNVSE		NSQDYQHGIF		QSIGFKEFHE		YLITEGKCTL
ETSNQLLKKG		IEALKQVTKR		YARKQNRWVK		NRFLSRPGPI		VPPVYGLEVS
DVSKWEESVL		EPALEIVQSF		IQGHKPTATP		IKMPYNEAEN		KRSYHLCDLC
DRIIIGDREW		AAHIKSKSHL		NQLKKRRRLD		SDAVNTIESQ		SVSPDHNKEP
KEKGSPGQND		QELKCSV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесинг тРНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії.

Література

• Golovko A., Hjalm G., Sitbon F., Nicander B. (2000). Cloning of a human tRNA isopentenyl transferase. Gene. 258: 85—93. PMID 11111046 DOI:10.1016/S0378-1119(00)00421-2
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1