TROVE2

TROVE2
Ідентифікатори
Символи	RO60, RORNP, SSA2, TROVE domain family member 2, Ro60, Y RNA binding protein, TROVE2
Зовнішні ІД	OMIM: 600063 MGI: 106652 HomoloGene: 3383 GeneCards: RO60
Онтологія гена Молекулярна функція • U2 snRNA binding • зв'язування з іоном металу • RNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • цитоплазма • нуклеоплазма • гіалоплазма • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • immune system development • transcription by RNA polymerase III • smoothened signaling pathway • response to UV • cilium assembly • cell projection organization • регуляція експресії генів • cellular response to interferon-alpha Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6738	20822
Ensembl	ENSG00000116747	ENSMUSG00000018199
UniProt	P10155	O08848
RefSeq (мРНК)	NM_001042369 NM_001042370 NM_001173524 NM_001173525 NM_004600 NM_001331020	NM_013835
RefSeq (білок)	NP_001035828 NP_001035829 NP_001166995 NP_001166996 NP_001317949 NP_004591	NP_038863
Локус (UCSC)	Хр. 1: 193.06 – 193.09 Mb	Хр. 1: 143.63 – 143.65 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TROVE2 (англ. TROVE domain family member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 538 амінокислот, а молекулярна маса — 60 671.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEESVNQMQP		LNEKQIANSQ		DGYVWQVTDM		NRLHRFLCFG		SEGGTYYIKE
QKLGLENAEA		LIRLIEDGRG		CEVIQEIKSF		SQEGRTTKQE		PMLFALAICS
QCSDISTKQA		AFKAVSEVCR		IPTHLFTFIQ		FKKDLKESMK		CGMWGRALRK
AIADWYNEKG		GMALALAVTK		YKQRNGWSHK		DLLRLSHLKP		SSEGLAIVTK
YITKGWKEVH		ELYKEKALSV		ETEKLLKYLE		AVEKVKRTRD		ELEVIHLIEE
HRLVREHLLT		NHLKSKEVWK		ALLQEMPLTA		LLRNLGKMTA		NSVLEPGNSE
VSLVCEKLCN		EKLLKKARIH		PFHILIALET		YKTGHGLRGK		LKWRPDEEIL
KALDAAFYKT		FKTVEPTGKR		FLLAVDVSAS		MNQRVLGSIL		NASTVAAAMC
MVVTRTEKDS		YVVAFSDEMV		PCPVTTDMTL		QQVLMAMSQI		PAGGTDCSLP
MIWAQKTNTP		ADVFIVFTDN		ETFAGGVHPA		IALREYRKKM		DIPAKLIVCG
MTSNGFTIAD		PDDRGMLDMC		GFDTGALDVI		RNFTLDMI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як біогенез та деградація війок, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Deutscher S.L., Harley J.B., Keene J.D. (1988). Molecular analysis of the 60-kDa human Ro ribonucleoprotein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 9479—9483. PMID 3200833 DOI:10.1073/pnas.85.24.9479
• Ben-Chetrit E., Gandy B.J., Tan E.M., Sulivan K.F. (1989). Isolation and characterization of a cDNA clone encoding the 60-kD component of the human SS-A/Ro ribonucleoprotein autoantigen. J. Clin. Invest. 83: 1284—1292. PMID 2649513 DOI:10.1172/JCI114013
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wang D., Buyon J.P., Zhu W., Chan E.K.L. (1999). Defining a novel 75-kDa phosphoprotein associated with SS-A/Ro and identification of distinct human autoantibodies. J. Clin. Invest. 104: 1265—1275. PMID 10545525 DOI:10.1172/JCI8003
• Bouffard P., Barbar E., Briere F., Boire G. (2000). Interaction cloning and characterization of RoBPI, a novel protein binding to human Ro ribonucleoproteins. RNA. 6: 66—78. PMID 10668799 DOI:10.1017/S1355838200990277
• Hogg J.R., Collins K. (2007). Human Y5 RNA specializes a Ro ribonucleoprotein for 5S ribosomal RNA quality control. Genes Dev. 21: 3067—3072. PMID 18056422 DOI:10.1101/gad.1603907

Див. також

• Хромосома 1