TSPOAP1

TSPOAP1
Ідентифікатори
Символи	TSPOAP1, PBR-IP, PRAX-1, PRAX1, RIM-BP1, RIMBP1, BZRAP1, TSPO associated protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 610764 MGI: 2450877 HomoloGene: 37961 GeneCards: TSPOAP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • benzodiazepine receptor binding • voltage-gated calcium channel activity involved in regulation of presynaptic cytosolic calcium levels Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • мітохондрія • calyx of Held • glutamatergic synapse Біологічний процес • C21-steroid hormone biosynthetic process • GO:0022610 життєдіяльність • neuromuscular synaptic transmission • regulation of presynaptic cytosolic calcium ion concentration • GO:0010554 neurotransmitter secretion • glutamate secretion Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9256	207777
Ensembl	ENSG00000005379	ENSMUSG00000034156
UniProt	O95153	Q7TNF8
RefSeq (мРНК)	NM_001261835 NM_004758 NM_024418	NM_172449
RefSeq (білок)	NP_001248764 NP_004749 NP_077729 NP_001248764.1 NP_004749.2 NP_077729.1 NP_004749.2 NP_077729.1	NP_766037
Локус (UCSC)	Хр. 17: 58.3 – 58.33 Mb	Хр. 11: 87.65 – 87.68 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TSPOAP1 (англ. TSPO associated protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 857 амінокислот, а молекулярна маса — 200 051.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEQLTTLPRP		GDPGAMEPWA		LPTWHSWTPG		RGGEPSSAAP		SIADTPPAAL
QLQELRSEES		SKPKGDGSSR		PVGGTDPEGA		EACLPSLGQQ		ASSSGPACQR
PEDEEVEAFL		KAKLNMSFGD		RPNLELLRAL		GELRQRCAIL		KEENQMLRKS
SFPETEEKVR		RLKRKNAELA		VIAKRLEERA		RKLQETNLRV		VSAPLPRPGT
SLELCRKALA		RQRARDLSET		ASALLAKDKQ		IAALQRECRE		LQARLTLVGK
EGPQWLHVRD		FDRLLRESQR		EVLRLQRQIA		LRNQRETLPL		PPSWPPGPAL
QARAGAPAPG		APGEATPQED		ADNLPVILGE		PEKEQRVQQL		ESELSKKRKK
CESLEQEARK		KQRRCEELEL		QLRQAQNENA		RLVEENSRLS		GRATEKEQVE
WENAELRGQL		LGVTQERDSA		LRKSQGLQSK		LESLEQVLKH		MREVAQRRQQ
LEVEHEQARL		SLREKQEEVR		RLQQAQAEAQ		REHEGAVQLL		ESTLDSMQAR
VRELEEQCRS		QTEQFSLLAQ		ELQAFRLHPG		PLDLLTSALD		CGSLGDCPPP
PCCCSIPQPC		RGSGPKDLDL		PPGSPGRCTP		KSSEPAPATL		TGVPRRTAKK
AESLSNSSHS		ESIHNSPKSC		PTPEVDTASE		VEELEADSVS		LLPAAPEGSR
GGARIQVFLA		RYSYNPFEGP		NENPEAELPL		TAGEYIYIYG		NMDEDGFFEG
ELMDGRRGLV		PSNFVERVSD		DDLLTSLPPE		LADLSHSSGP		ELSFLSVGGG
GSSSGGQSSV		GRSQPRPEEE		DAGDELSLSP		SPEGLGEPPA		VPYPRRLVVL
KQLAHSVVLA		WEPPPEQVEL		HGFHICVNGE		LRQALGPGAP		PKAVLENLDL
WAGPLHISVQ		ALTSRGSSDP		LRCCLAVGAR		AGVVPSQLRV		HRLTATSAEI
TWVPGNSNLA		HAIYLNGEEC		PPASPSTYWA		TFCHLRPGTP		YQAQVEAQLP
PQGPWEPGWE		RLEQRAATLQ		FTTLPAGPPD		APLDVQIEPG		PSPGILIISW
LPVTIDAAGT		SNGVRVTGYA		IYADGQKIME		VASPTAGSVL		VELSQLQLLQ
VCREVVVRTM		SPHGESADSI		PAPITPALAP		ASLPARVSCP		SPHPSPEARA
PLASASPGPG		DPSSPLQHPA		PLGTQEPPGA		PPASPSREMA		KGSHEDPPAP
CSQEEAGAAV		LGTSEERTAS		TSTLGEKDPG		PAAPSLAKQE		AEWTAGEACP
ASSSTQGARA		QQAPNTEMCQ		GGDPGSGLRP		RAEKEDTAEL		GVHLVNSLVD
HGRNSDLSDI		QEEEEEEEEE		EEEELGSRTC		SFQKQVAGNS		IRENGAKSQP
DPFCETDSDE		EILEQILELP		LQQFCSKKLF		SIPEEEEEEE		EDEEEEKSGA
GCSSRDPGPP		EPALLGLGCD		SGQPRRPGQC		PLSPESSRAG		DCLEDMPGLV
GGSSRRRGGG		SPEKPPSRRR		PPDPREHCSR		LLSNNGPQAS		GRLGPTRERG
GLPVIEGPRT		GLEASGRGRL		GPSRRCSRGR		ALEPGLASCL		SPKCLEISIE
YDSEDEQEAG		SGGISITSSC		YPGDGEAWGT		ATVGRPRGPP		KANSGPKPYP
RLPAWEKGEP		ERRGRSATGR		AKEPLSRATE		TGEARGQDGS		GRRGPQKRGV
RVLRPSTAEL		VPARSPSETL		AYQHLPVRIF		VALFDYDPVS		MSPNPDAGEE
ELPFREGQIL		KVFGDKDADG		FYQGEGGGRT		GYIPCNMVAE		VAVDSPAGRQ
QLLQRGYLSP		DILLEGSGNG		PFVYSTAHTT		GPPPKPRRSK		KAESEGPAQP
CPGPPKLVPS		ADLKAPHSMV		AAFDYNPQES		SPNMDVEAEL		PFRAGDVITV
FGGMDDDGFY		YGELNGQRGL		VPSNFLEGPG		PEAGGLDREP		RTPQAESQRT
RRRRVQC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 17