TTC39B

TTC39B
Ідентифікатори
Символи	TTC39B, C9orf52, tetratricopeptide repeat domain 39B
Зовнішні ІД	OMIM: 613574 MGI: 1917113 HomoloGene: 25228 GeneCards: TTC39B
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	158219	69863
Ensembl	ENSG00000155158	ENSMUSG00000038172
UniProt	Q5VTQ0	Q8BYY4
RefSeq (мРНК)	NM_001168339 NM_001168340 NM_001168341 NM_001168342 NM_152574	NM_025782 NM_027238
RefSeq (білок)	NP_001161811 NP_001161812 NP_001161813 NP_001161814 NP_689787	NP_081514
Локус (UCSC)	Хр. 9: 15.16 – 15.31 Mb	Хр. 4: 83.14 – 83.24 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TTC39B (англ. Tetratricopeptide repeat domain 39B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 682 амінокислот, а молекулярна маса — 76 956.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDAVLACRLR		GRGNRVAALR		PRPRPGGSAG		PSPFALLCAG		LSPEPRAGVG
SEFPAWFLGG		SSQRRNMALL		GSRAELEADE		DVFEDALETI		SISSHSDMAT
SSLHFASCDT		QQAPRQRGAS		TVSSSSSTKV		DLKSGLEECA		VALNLFLSNK
FTDALELLRP		WAKESMYHAL		GYSTIVVLQA		VLTFEQQDIQ		NGISAMKDAL
QTCQKYRKKY		TVVESFSSLL		SRGSLEQLSE		EEMHAEICYA		ECLLQKAALT
FVQDENMINF		IKGGLKIRTS		YQIYKECLSI		LHEIQKNKLQ		QEFFYEFEGG
VKLGSGAFNL		MLSLLPARII		RLLEFIGFSG		NRELGLLQLR		EGASGRSMRS
ALCCLTILAF		HTYISLILGT		GEVNVAEAER		LLAPFLQQFP		NGSLVLFYHA
RIELLKGNLE		EAQEVFQKCI		SVQEEWKQFH		HLCYWELMWI		NVFQQNWMQA
YYYSDLLCKE		SKWSKATYVF		LKAAILSMLP		EEDVVATNEN		VVTLFRQVDS
LKQRIAGKSI		PTEKFAVRKA		RRYSASLPAP		VKLILPALEM		MYVWNGFSIV
SKRKDLSENL		LVTVEKAEAA		LQSQNFNSFS		VDDECLVKLL		KGCCLKNLQR
PLQAELCYNH		VVESEKLLKY		DHYLVPFTLF		ELASLYKSQG		EIDKAIKFLE
TARNNYKDYS		LESRLHFRIQ		AALHLWRKPS		SD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9