UBAP1

UBAP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WGN, 4AE4
Ідентифікатори
Символи	UBAP1, NAG20, UAP, UBAP, UBAP-1, ubiquitin associated protein 1, SPG80
Зовнішні ІД	OMIM: 609787 MGI: 2149543 HomoloGene: 9554 GeneCards: UBAP1
Онтологія гена Молекулярна функція • ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • ендосома • клітинна мембрана • комплекс Ґольджі • ESCRT I complex • endosome membrane • host cell Біологічний процес • protein transport • ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway • endosomal transport • GO:0019067 viral life cycle • GO:0046795 intracellular transport of virus Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51271	67123
Ensembl	ENSG00000165006	ENSMUSG00000028437
UniProt	Q9NZ09	Q8BH48
RefSeq (мРНК)	NM_001171201 NM_001171202 NM_001171203 NM_001171204 NM_016525	NM_001290454 NM_023305 NM_001355508 NM_001355509
RefSeq (білок)	NP_001164672 NP_001164673 NP_001164674 NP_001164675 NP_057609	NP_001277383 NP_075794 NP_001342437 NP_001342438
Локус (UCSC)	Хр. 9: 34.18 – 34.25 Mb	Хр. 4: 41.35 – 41.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

UBAP1 (англ. Ubiquitin associated protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 502 амінокислот, а молекулярна маса — 55 084.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASKKLGADF		HGTFSYLDDV		PFKTGDKFKT		PAKVGLPIGF		SLPDCLQVVR
EVQYDFSLEK		KTIEWAEEIK		KIEEAEREAE		CKIAEAEAKV		NSKSGPEGDS
KMSFSKTHST		ATMPPPINPI		LASLQHNSIL		TPTRVSSSAT		KQKVLSPPHI
KADFNLADFE		CEEDPFDNLE		LKTIDEKEEL		RNILVGTTGP		IMAQLLDNNL
PRGGSGSVLQ		DEEVLASLER		ATLDFKPLHK		PNGFITLPQL		GNCEKMSLSS
KVSLPPIPAV		SNIKSLSFPK		LDSDDSNQKT		AKLASTFHST		SCLRNGTFQN
SLKPSTQSSA		SELNGHHTLG		LSALNLDSGT		EMPALTSSQM		PSLSVLSVCT
EESSPPNTGP		TVTPPNFSVS		QVPNMPSCPQ		AYSELQMLSP		SERQCVETVV
NMGYSYECVL		RAMKKKGENI		EQILDYLFAH		GQLCEKGFDP		LLVEEALEMH
QCSEEKMMEF		LQLMSKFKEM		GFELKDIKEV		LLLHNNDQDN		ALEDLMARAG
AS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9