UBR1

UBR1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3NY1
Ідентифікатори
Символи	UBR1, JBS, ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605981 MGI: 1277977 HomoloGene: 7582 GeneCards: UBR1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • zinc ion binding • leucine binding • зв'язування з іоном металу • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • Протеасома • гіалоплазма • ubiquitin ligase complex Біологічний процес • negative regulation of TOR signaling • cellular response to leucine • ubiquitin-dependent protein catabolic process via the N-end rule pathway • GO:0044257 protein catabolic process • Убіквітин-залежний протеоліз • ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	197131	22222
Ensembl	ENSG00000159459	ENSMUSG00000027272
UniProt	Q8IWV7	O70481
RefSeq (мРНК)	NM_174916	NM_009461
RefSeq (білок)	NP_777576	NP_033487
Локус (UCSC)	Хр. 15: 42.94 – 43.11 Mb	Хр. 2: 120.69 – 120.8 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

UBR1 (англ. Ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 749 амінокислот, а молекулярна маса — 200 211.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADEEAGGTE		RMEISAELPQ		TPQRLASWWD		QQVDFYTAFL		HHLAQLVPEI
YFAEMDPDLE		KQEESVQMSI		FTPLEWYLFG		EDPDICLEKL		KHSGAFQLCG
RVFKSGETTY		SCRDCAIDPT		CVLCMDCFQD		SVHKNHRYKM		HTSTGGGFCD
CGDTEAWKTG		PFCVNHEPGR		AGTIKENSRC		PLNEEVIVQA		RKIFPSVIKY
VVEMTIWEEE		KELPPELQIR		EKNERYYCVL		FNDEHHSYDH		VIYSLQRALD
CELAEAQLHT		TAIDKEGRRA		VKAGAYAACQ		EAKEDIKSHS		ENVSQHPLHV
EVLHSEIMAH		QKFALRLGSW		MNKIMSYSSD		FRQIFCQACL		REEPDSENPC
LISRLMLWDA		KLYKGARKIL		HELIFSSFFM		EMEYKKLFAM		EFVKYYKQLQ
KEYISDDHDR		SISITALSVQ		MFTVPTLARH		LIEEQNVISV		ITETLLEVLP
EYLDRNNKFN		FQGYSQDKLG		RVYAVICDLK		YILISKPTIW		TERLRMQFLE
GFRSFLKILT		CMQGMEEIRR		QVGQHIEVDP		DWEAAIAIQM		QLKNILLMFQ
EWCACDEELL		LVAYKECHKA		VMRCSTSFIS		SSKTVVQSCG		HSLETKSYRV
SEDLVSIHLP		LSRTLAGLHV		RLSRLGAVSR		LHEFVSFEDF		QVEVLVEYPL
RCLVLVAQVV		AEMWRRNGLS		LISQVFYYQD		VKCREEMYDK		DIIMLQIGAS
LMDPNKFLLL		VLQRYELAEA		FNKTISTKDQ		DLIKQYNTLI		EEMLQVLIYI
VGERYVPGVG		NVTKEEVTMR		EIIHLLCIEP		MPHSAIAKNL		PENENNETGL
ENVINKVATF		KKPGVSGHGV		YELKDESLKD		FNMYFYHYSK		TQHSKAEHMQ
KKRRKQENKD		EALPPPPPPE		FCPAFSKVIN		LLNCDIMMYI		LRTVFERAID
TDSNLWTEGM		LQMAFHILAL		GLLEEKQQLQ		KAPEEEVTFD		FYHKASRLGS
SAMNIQMLLE		KLKGIPQLEG		QKDMITWILQ		MFDTVKRLRE		KSCLIVATTS
GSESIKNDEI		THDKEKAERK		RKAEAARLHR		QKIMAQMSAL		QKNFIETHKL
MYDNTSEMPG		KEDSIMEEES		TPAVSDYSRI		ALGPKRGPSV		TEKEVLTCIL
CQEEQEVKIE		NNAMVLSACV		QKSTALTQHR		GKPIELSGEA		LDPLFMDPDL
AYGTYTGSCG		HVMHAVCWQK		YFEAVQLSSQ		QRIHVDLFDL		ESGEYLCPLC
KSLCNTVIPI		IPLQPQKINS		ENADALAQLL		TLARWIQTVL		ARISGYNIRH
AKGENPIPIF		FNQGMGDSTL		EFHSILSFGV		ESSIKYSNSI		KEMVILFATT
IYRIGLKVPP		DERDPRVPML		TWSTCAFTIQ		AIENLLGDEG		KPLFGALQNR
QHNGLKALMQ		FAVAQRITCP		QVLIQKHLVR		LLSVVLPNIK		SEDTPCLLSI
DLFHVLVGAV		LAFPSLYWDD		PVDLQPSSVS		SSYNHLYLFH		LITMAHMLQI
LLTVDTGLPL		AQVQEDSEEA		HSASSFFAEI		SQYTSGSIGC		DIPGWYLWVS
LKNGITPYLR		CAALFFHYLL		GVTPPEELHT		NSAEGEYSAL		CSYLSLPTNL
FLLFQEYWDT		VRPLLQRWCA		DPALLNCLKQ		KNTVVRYPRK		RNSLIELPDD
YSCLLNQASH		FRCPRSADDE		RKHPVLCLFC		GAILCSQNIC		CQEIVNGEEV
GACIFHALHC		GAGVCIFLKI		RECRVVLVEG		KARGCAYPAP		YLDEYGETDP
GLKRGNPLHL		SRERYRKLHL		VWQQHCIIEE		IARSQETNQM		LFGFNWQLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yin J., Kwon Y.T., Varshavsky A., Wang W. (2004). RECQL4, mutated in the Rothmund-Thomson and RAPADILINO syndromes, interacts with ubiquitin ligases UBR1 and UBR2 of the N-end rule pathway. Hum. Mol. Genet. 13: 2421—2430. PMID 15317757 DOI:10.1093/hmg/ddh269
• Matta-Camacho E., Kozlov G., Li F.F., Gehring K. (2010). Structural basis of substrate recognition and specificity in the N-end rule pathway. Nat. Struct. Mol. Biol. 17: 1182—1187. PMID 20835242 DOI:10.1038/nsmb.1894

Див. також

• Хромосома 15