UBXN11

UBXN11
Ідентифікатори
Символи	UBXN11, COA-1, SOC, SOCI, UBXD5, PP2243, UBX domain protein 11
Зовнішні ІД	OMIM: 609151 MGI: 1914836 HomoloGene: 12159 GeneCards: UBXN11
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння
Онтологія гена Молекулярна функція • ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • цитоскелет Біологічний процес • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	91544	67586
Ensembl	ENSG00000158062	ENSMUSG00000012126
UniProt	Q5T124	Q9D572
RefSeq (мРНК)	NM_183008 NM_001077262 NM_145345 NM_001389556 NM_001389559	NM_026257
RefSeq (білок)	NP_001070730 NP_663320 NP_892120	NP_080533
Локус (UCSC)	Хр. 1: 26.28 – 26.32 Mb	Хр. 4: 133.83 – 133.85 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

UBXN11 (англ. UBX domain protein 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 520 амінокислот, а молекулярна маса — 57 373.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSPLASLSK		TRKVPLPSEP		MNPGRRGIRI		YGDEDEVDML		SDGCGSEEKI
SVPSCYGGIG		APVSRQVPAS		HDSELMAFMT		RKLWDLEQQV		KAQTDEILSK
DQKIAALEDL		VQTLRPHPAE		ATLQRQEELE		TMCVQLQRQV		REMERFLSDY
GLQWVGEPMD		QEDSESKTVS		EHGERDWMTA		KKFWKPGDSL		APPEVDFDRL
LASLQDLSEL		VVEGDTQVTP		VPGGARLRTL		EPIPLKLYRN		GIMMFDGPFQ
PFYDPSTQRC		LRDILDGFFP		SELQRLYPNG		VPFKVSDLRN		QVYLEDGLDP
FPGEGRVVGR		QLMHKALDRV		EEHPGSRMTA		EKFLNRLPKF		VIRQGEVIDI
RGPIRDTLQN		CCPLPARIQE		IVVETPTLAA		ERERSQESPN		TPAPPLSMLR
IKSENGEQAF		LLMMQPDNTI		GDVRALLAQA		RVMDASAFEI		FSTFPPTLYQ
DDTLTLQAAG		LVPKAALLLR		ARRAPKSSLK		FSPGPCPGPG		PGPSPGPGPG
PSPGPGPGPS		PCPGPSPSPQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Katoh H., Harada A., Mori K., Negishi M. (2002). Socius is a novel Rnd GTPase-interacting protein involved in disassembly of actin stress fibers. Mol. Cell. Biol. 22: 2952—2964. PMID 11940653 DOI:10.1128/MCB.22.9.2952-2964.2002
• Maccalli C., Li Y.F., El-Gamil M., Rosenberg S.A., Robbins P.F. (2003). Identification of a colorectal tumor-associated antigen (COA-1) recognized by CD4(+) T lymphocytes. Cancer Res. 63: 6735—6743. PMID 14583468

Див. також

• Хромосома 1