UGDH

UGDH
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2Q3E, 2QG4, 3ITK, 3KHU, 3PRJ, 3PTZ, 3TDK, 3TF5, 4EDF, 4QEJ, 4RJT
Ідентифікатори
Символи	UGDH, GDH, UDP-GlcDH, UDPGDH, UGD, UDP-glucose 6-dehydrogenase, EIEE84, DEE84
Зовнішні ІД	OMIM: 603370 MGI: 1306785 HomoloGene: 2520 GeneCards: UGDH
Онтологія гена Молекулярна функція • NAD binding • каталітична активність • oxidoreductase activity • electron transfer activity • GO:0050229 oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor • UDP-glucose 6-dehydrogenase activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • екзосома • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • UDP-glucuronate biosynthetic process • gastrulation with mouth forming second • обмін речовин • UDP-glucose metabolic process • glycosaminoglycan biosynthetic process • Електронтранспортний ланцюг • heparan sulfate proteoglycan biosynthetic process • chondroitin sulfate biosynthetic process • protein hexamerization • carbohydrate metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7358	22235
Ensembl	ENSG00000109814	ENSMUSG00000029201
UniProt	O60701	O70475
RefSeq (мРНК)	NM_001184700 NM_001184701 NM_003359	NM_009466
RefSeq (білок)	NP_001171629 NP_001171630 NP_003350	NP_033492
Локус (UCSC)	Хр. 4: 39.5 – 39.53 Mb	Хр. 5: 65.57 – 65.59 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

UGDH (англ. UDP-glucose 6-dehydrogenase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 494 амінокислот, а молекулярна маса — 55 024.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFEIKKICCI		GAGYVGGPTC		SVIAHMCPEI		RVTVVDVNES		RINAWNSPTL
PIYEPGLKEV		VESCRGKNLF		FSTNIDDAIK		EADLVFISVN		TPTKTYGMGK
GRAADLKYIE		ACARRIVQNS		NGYKIVTEKS		TVPVRAAESI		RRIFDANTKP
NLNLQVLSNP		EFLAEGTAIK		DLKNPDRVLI		GGDETPEGQR		AVQALCAVYE
HWVPREKILT		TNTWSSELSK		LAANAFLAQR		ISSINSISAL		CEATGADVEE
VATAIGMDQR		IGNKFLKASV		GFGGSCFQKD		VLNLVYLCEA		LNLPEVARYW
QQVIDMNDYQ		RRRFASRIID		SLFNTVTDKK		IAILGFAFKK		DTGDTRESSS
IYISKYLMDE		GAHLHIYDPK		VPREQIVVDL		SHPGVSEDDQ		VSRLVTISKD
PYEACDGAHA		VVICTEWDMF		KELDYERIHK		KMLKPAFIFD		GRRVLDGLHN
ELQTIGFQIE		TIGKKVSSKR		IPYAPSGEIP		KFSLQDPPNK		KPKV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з НАД.

Література

• Spicer A.P., Kaback L.A., Smith T.J., Seldin M.F. (1998). Molecular cloning and characterization of the human and mouse UDP-glucose dehydrogenase genes. J. Biol. Chem. 273: 25117—25124. PMID 9737970 DOI:10.1074/jbc.273.39.25117
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sennett N.C., Kadirvelraj R., Wood Z.A. (2011). Conformational flexibility in the allosteric regulation of human UDP-alpha-D-glucose 6-dehydrogenase. Biochemistry. 50: 9651—9663. PMID 21961565 DOI:10.1021/bi201381e
• Egger S., Chaikuad A., Kavanagh K.L., Oppermann U., Nidetzky B. (2011). Structure and mechanism of human UDP-glucose 6-dehydrogenase. J. Biol. Chem. 286: 23877—23887. PMID 21502315 DOI:10.1074/jbc.M111.234682
• Peng H.L., Lou M.D., Chang M.L., Chang H.Y. (1998). cDNA cloning and expression analysis of the human UDPglucose dehydrogenase. Proc. Natl. Sci. Counc. Repub. China, B, Life Sci. 22: 166—172. PMID 9850599

Див. також

• Хромосома 4